RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 SLAQ13239 276 aa7.88□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.87□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.87□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 TWIST1Q15672 202 aa7.87□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.87□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.87□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 TENM3Q9P273 2699 aa7.87□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.86□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 INSP01308 110 aa7.86□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 HOXA5P20719 270 aa7.86□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.86□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.86□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.86□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.86□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.86□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2CO00762 179 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 IGLL1P15814 213 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 SRIP30626 198 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 SSTP61278 116 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 Q0VG73 95 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 Q8N1Y9 231 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 C9orf85Q96MD7 179 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.85□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 NXPH4O95158 308 aa7.84□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.84□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.84□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.84□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 XCL2Q9UBD3 114 aa7.84□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.84□□□□□ -1.15
ECHDC3-204ENST00000495787 CBY3A6NI87 242 aa7.83□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 AMN1Q8IY45 258 aa7.83□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 DEFB125Q8N687 156 aa7.83□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC01587Q99440 93 aa7.83□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.83□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 MUC4Q99102 2169 aa7.83□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 M0R381 172 aa7.82□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB4AP20338 218 aa7.82□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.82□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 BAGE3Q86Y29 109 aa7.82□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.82□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.82□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF185Q96GF1 192 aa7.82□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 MDFICQ9P1T7 246 aa7.82□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 U3KQK5 164 aa7.82□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 SPRY2O43597 315 aa7.81□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 EVI2AP22794 236 aa7.81□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF415Q09FC8 603 aa7.81□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.81□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 SYT8Q8NBV8 401 aa7.81□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.81□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.81□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 COL7A1Q02388 2944 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 PPBPP02775 128 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 ESDP10768 282 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 HTN1P15515 57 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 IQCJQ1A5X6 159 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 ORMDL3Q8N138 153 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 PTH2Q96A98 100 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 AP1S3Q96PC3 154 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 SPXQ9BT56 116 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.8□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 D6R8Y8 96 aa7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 SERF1AO75920 110 aa7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 S100A2P29034 98 aa7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 CKS2P33552 79 aa7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00310P59036 64 aa7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 PRELID3AQ96N28 172 aa7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 CSTL1Q9H114 145 aa7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.79□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 IFITM10A6NMD0 228 aa7.78□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 M0R2P5 195 aa7.78□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 NUPR1O60356 82 aa7.78□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.78□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.78□□□□□ -1.16
ECHDC3-204ENST00000495787 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms