RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 PRR25Q96S07 402 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 DPM2O94777 84 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 CDKN1BP46527 198 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 PDE6HQ13956 83 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 STHQ8IWL8 128 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 C11orf52Q96A22 123 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf159Q96HA4 380 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1B0GW15 77 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 B5MCH6 92 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 NDUFA4O00483 81 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 OVOL1O14753 267 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 BUB3O43684 328 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 C3orf56Q8N813 242 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 SYT8Q8NBV8 401 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 IGKCP01834 107 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 RRN3P1Q2M238 152 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 KNCNA6PVL3 124 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP5LO75964 103 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHG2P01859 326 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00477Q96M19 166 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 CCDC140Q96MF4 163 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 XCL2Q9UBD3 114 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 A6NDX4 124 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A087WWL8 130 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 FSTL3O95633 263 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 FOXE3Q13461 319 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 KIR2DL4Q99706 377 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 SMR3AQ99954 134 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 ATRQ13535 2644 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 Q0VG73 95 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 DNAL4O96015 105 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 OR9G4Q8NGQ1 327 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A087WW49 117 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 YPEL4Q96NS1 127 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP6V0BQ99437 205 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 CSTL1Q9H114 145 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 SMPXQ9UHP9 88 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 C9JAW5 83 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC01619G3V211 115 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 RS1O15537 224 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHV3-53P01767 116 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 Q6AWC8 147 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 ELANEP08246 267 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 C16orf54Q6UWD8 224 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 PPP1R17O96001 155 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 HTN3P15516 51 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 PLA2G2AP14555 144 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 C9orf118A6NHY6 69 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 EBI3Q14213 229 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 RNF114Q9Y508 228 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 GNRH2O43555 120 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRVP-201ENST00000482597 LTAP01374 205 aa7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms