RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477552.1

PTPRD-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRD, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-209ENST00000477552 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 RASL10AQ92737 203 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 CST9LQ9H4G1 147 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 ATRXP46100 2492 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 ITPR1Q14643 2758 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 A0A0J9YX75 114 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 K7EQG2 157 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 RIPPLY3P57055 190 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 SCGB2A2Q13296 93 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 PMVKQ15126 192 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 PRR31Q5SQ13 230 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 TMEM86BQ8N661 226 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 C9orf85Q96MD7 179 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 CSTL1Q9H114 145 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 KLK15Q9H2R5 256 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 PEMTQ9UBM1 199 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 TRBV12-3P01733 135 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 IGHV3-11P01762 117 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 MGPP08493 103 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 GCSHP23434 173 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 BLCAPP62952 87 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 PRR9Q5T870 116 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 Q6YL49 198 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 PCP2Q8IVA1 136 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 HIST1H4GQ99525 98 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 A0A1B0GWB2 263 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 C11orf86A6NJI1 115 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 A8MTW9 85 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 F8W1H4 67 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 H3BUT2 72 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 FSHBP01225 129 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 CD7P09564 240 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 Q8N2B8 174 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRD-209ENST00000477552 LAMA5O15230 3695 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 A8MWV9 139 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 F5H697 171 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 RHODO00212 210 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 FXYD7P58549 80 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 RBX1P62877 108 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 Q5PR19 223 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 BAALCQ8WXS3 180 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 SPXQ9BT56 116 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 MED13LQ71F56 2210 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 CACNA1AO00555 2505 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 IGIPA6NJ69 53 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 GNRH2O43555 120 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 TGFAP01135 160 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 LINC00315P59091 139 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 VCX2Q9H322 139 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 A0A096LNT2 108 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 I3L3M4 83 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 GAS8-AS1O95177 125 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 IGHV4-59P01825 116 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRD-209ENST00000477552 NFE4Q86UQ8 179 aa6.25□□□□□ -1.41
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