RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 ATP5G1P05496 136 aa6.25□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 DNLZQ5SXM8 178 aa6.25□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 CASC10Q5T4H9 136 aa6.25□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 UQCC3Q6UW78 93 aa6.25□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 RASL10AQ92737 203 aa6.25□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 TPPP3Q9BW30 176 aa6.25□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.25□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 XKRY2A2RUG3 117 aa6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 IGLL5B9A064 214 aa6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 M0R381 172 aa6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 CXCL1P09341 107 aa6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 SSTP61278 116 aa6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 ISOC2Q96AB3 205 aa6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM218A2RU14 115 aa6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 HOXA5P20719 270 aa6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 ZFP82Q8N141 532 aa6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 SYT8Q8NBV8 401 aa6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 SFRP2Q96HF1 295 aa6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 F8W036 122 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 SNAI2O43623 268 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 OR5AL1P0C617 328 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 IGLC6P0CF74 106 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 MED14OSP0DP75 135 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 ADCYAP1P18509 176 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 PTH2Q96A98 100 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF479Q96JC4 524 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 C18orf15Q96N68 181 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 JPT2Q9H910 190 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 OSTCQ9NRP0 149 aa6.22□□□□□ -1.41
CASQ1-202ENST00000467691 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 A0A0J9YY99 117 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 A8MWL6 223 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 RS1O15537 224 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 GTSF1Q8WW33 167 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 V9GYV3 84 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 MUC4Q99102 2169 aa6.21□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 A0A087WWL8 130 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1W2PPQ1 181 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 A8MWV9 139 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 F2Z2F3 143 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 NXPH4O95158 308 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 FHL2Q14192 279 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 CT83Q5H943 113 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 TSKUQ8WUA8 353 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.2□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 NUDT3O95989 172 aa6.19□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 CTRLP40313 264 aa6.19□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 CACNG7P62955 275 aa6.19□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 FAM210BQ96KR6 192 aa6.19□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 SEC11CQ9BY50 192 aa6.19□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.19□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 PRO0255Q9UI72 69 aa6.19□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 TENM2Q9NT68 2774 aa6.19□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 HIGD1CA8MV81 97 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 PAX4O43316 350 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 NTF3P20783 257 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 CRYBA4P53673 196 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 SLAQ13239 276 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 TWIST1Q15672 202 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 RNF212Q495C1 297 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 BORCS7Q96B45 105 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.18□□□□□ -1.42
CASQ1-202ENST00000467691 AP1S3Q96PC3 154 aa6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms