RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MPC1Q9Y5U8 109 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AGRNO00468 2067 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C7orf71A4D174 169 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A8MUN3 132 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FNDC10F2Z333 226 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 G3V318 75 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LST1O00453 97 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBE2L6O14933 153 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF737O75373 536 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NFYBP25208 207 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FXYD6P3P58550 94 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00313P59037 77 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF880Q6PDB4 577 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCN15Q6UWW0 184 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GTSCR1Q86UQ5 136 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF709Q8N972 641 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q8N9W7 124 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2T10Q8NGZ9 312 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AQP3Q92482 292 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TOMM6Q96B49 74 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GINS4Q9BRT9 223 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OCR1Q9BZK8 76 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MDFICQ9P1T7 246 aa4.02□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C16orf90A8MZG2 172 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 B4DEV8 164 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC179H3BU77 68 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 M0R2N4 97 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COX7A2LO14548 114 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-7P01780 117 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HLA-DQB1P01920 261 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD7P09564 240 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SDC2P34741 201 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 REG3AQ06141 175 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q8N6K4 173 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC25A46Q96AG3 418 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PARLQ9H300 379 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CKLFQ9UBR5 152 aa4.01□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IRGMA1A4Y4 181 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-11P01762 117 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPINK8P0C7L1 97 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IL3RAP26951 378 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CATR1Q13166 79 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRN3P1Q2M238 152 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM252Q8N6L7 170 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR10AC1Q8NH08 325 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C15orf40Q8WUR7 153 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LEAP2Q969E1 77 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C18orf15Q96N68 181 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUSP21Q9H596 190 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COMMD3Q9UBI1 195 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FUT9Q9Y231 359 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00312Q9Y6C7 94 aa4□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAX1BP3O14907 124 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-48P01763 117 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IL7P13232 177 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKR1C2P52895 323 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AMTNQ6UX39 209 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LCA10Q71F78 164 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NFE4Q86UQ8 179 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR4K13Q8NH42 304 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC25A22Q9H936 323 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SAR1AQ9NR31 198 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APLNQ9ULZ1 77 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.98□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.98□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF727A8MUV8 499 aa3.98□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OOSP1A8MZH6 123 aa3.98□□□□□ -1.77
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLL5B9A064 214 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 146.4 ms