RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 SRIP30626 198 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 CAMPP49913 170 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 AKR1D1P51857 326 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP10-3P60369 221 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 RAB4BP61018 213 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TDRG1Q3Y452 100 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 PSMG4Q5JS54 123 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 DUX3Q96PT4 197 aa4.46□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
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C6orf48-208ENST00000395788 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 SERF1AO75920 110 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 NXPH4O95158 308 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 GPX1P07203 203 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 HLA-DRB4P13762 266 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 S100A2P29034 98 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 LEPP41159 167 aa4.45□□□□□ -1.7
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C6orf48-208ENST00000395788 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 Q6ZQT7 251 aa4.45□□□□□ -1.7
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C6orf48-208ENST00000395788 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM18Q96B42 140 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 BORCS7Q96B45 105 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.45□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 C7orf71A4D174 169 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 OR4C46A6NHA9 309 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 H3BMM0 161 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 FABP4P15090 132 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 NTF3P20783 257 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TSPOP30536 169 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TFPI2P48307 235 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 PYY3Q5JQD4 70 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 DEFB125Q8N687 156 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 RNF185Q96GF1 192 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 RCHY1Q96PM5 261 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 HIVEP1P15822 2718 aa4.44□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PRX2 142 aa4.43□□□□□ -1.7
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C6orf48-208ENST00000395788 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 LINC01546A6NGU7 62 aa4.43□□□□□ -1.7
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C6orf48-208ENST00000395788 IGLV1-51P01701 117 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 RAB4AP20338 218 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 CDKN1BP46527 198 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 DEFB131AP59861 70 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TWIST1Q15672 202 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.43□□□□□ -1.7
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C6orf48-208ENST00000395788 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 OR10AG1Q8NH19 301 aa4.43□□□□□ -1.7
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C6orf48-208ENST00000395788 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 KCNS1Q96KK3 526 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 C12orf57Q99622 126 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TPPP3Q9BW30 176 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.43□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.43□□□□□ -1.7
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C6orf48-208ENST00000395788 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 IQCJQ1A5X6 159 aa4.42□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.42□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 Q6ZWC4 215 aa4.42□□□□□ -1.7
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C6orf48-208ENST00000395788 C9orf85Q96MD7 179 aa4.42□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 MUC21A0A140T8X8 626 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 KNCNA6PVL3 124 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 D6R8Y8 96 aa4.41□□□□□ -1.7
C6orf48-208ENST00000395788 H3BVH4 76 aa4.41□□□□□ -1.7
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