RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381218.8

ZBED1-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 2,832 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-201ENST00000381218 ERCC8Q13216 396 aa11.69□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 PRR25Q96S07 402 aa11.69□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.69□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.69□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa11.69□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 NDPQ00604 133 aa11.69□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 GAGE5Q13069 117 aa11.69□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 GAGE6Q13070 117 aa11.69□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa11.69□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 C21orf62Q9NYP8 219 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 ATP5LO75964 103 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 ITPR2Q14571 2701 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 F8W735 103 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 IGHV4-39P01824 125 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 HERV-K104P63124 156 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 TMEM219Q86XT9 240 aa11.68□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 OOSP1A8MZH6 123 aa11.67□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 Q8N6K4 173 aa11.67□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 PRAC2D3DTV9 90 aa11.67□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 PDE6HQ13956 83 aa11.67□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 MINOS1Q5TGZ0 78 aa11.67□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.67□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 TEX29Q8N6K0 151 aa11.67□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa11.67□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 TAL2Q16559 108 aa11.66□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 Q6ZQT7 251 aa11.66□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 DTX2Q86UW9 622 aa11.66□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 RNF182Q8N6D2 247 aa11.66□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 IGHG4P01861 327 aa11.66□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.541e-6■■□□□ 12
ZBED1-201ENST00000381218 SMIM20Q8N5G0 67 aa11.66□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 EBI3Q14213 229 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.65□□□□□ -0.54
ZBED1-201ENST00000381218 TRGV3P03979 118 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 SPRY2O43597 315 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 SCGB2A1O75556 95 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 IGLC6P0CF74 106 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 SIRPDQ9H106 197 aa11.64□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 A0A087WX48 190 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 CTSGP08311 255 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 PSMG4Q5JS54 123 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.63□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 CCDC179H3BU77 68 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 TEN1Q86WV5 123 aa11.63□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 TCL1BO95988 128 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 SAA4P35542 130 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 IL17RELQ6ZVW7 336 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 Q8N8P6 123 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 Q8N9W7 124 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 AJUBAQ96IF1 538 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF688P0C7X2 276 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 LAGE3Q14657 143 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ECSCRQ19T08 205 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ANKRD29Q8N6D5 301 aa11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ZNF815PA8K554 130 aa11.61□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 SCGB1C2P0DMR2 95 aa11.61□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 LMO4P61968 165 aa11.61□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.61□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.6□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 CCL19Q99731 98 aa11.6□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 G3V318 75 aa11.6□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ATP5J2P56134 94 aa11.6□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 LY6EQ16553 131 aa11.6□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 A8MWV9 139 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 PLNP26678 52 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 CRLF1O75462 422 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 SLC25A16P16260 332 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 UBE2E1P51965 193 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 EMP1P54849 157 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 ITPR3Q14573 2671 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.59□□□□□ -0.55
ZBED1-201ENST00000381218 J3KRW8 73 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.9 ms