RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
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HOXD1-201ENST00000331462 OR11H1Q8NG94 326 aa16.97■□□□□ 0.31
HOXD1-201ENST00000331462 OR11H2Q8NH07 326 aa16.97■□□□□ 0.31
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HOXD1-201ENST00000331462 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa16.84■□□□□ 0.29
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HOXD1-201ENST00000331462 PSMB8P28062 276 aa16.84■□□□□ 0.29
HOXD1-201ENST00000331462 C9orf85Q96MD7 179 aa16.84■□□□□ 0.29
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HOXD1-201ENST00000331462 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 JPT2Q9H910 190 aa16.8■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.8■□□□□ 0.28
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HOXD1-201ENST00000331462 B4DSR2 109 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 GATA3P23771 443 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 UBE2D1P51668 147 aa16.79■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 SCGB2A2Q13296 93 aa16.79■□□□□ 0.28
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