RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 CACNG7P62955 275 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-201ENST00000298838 SPANXN1Q5VSR9 72 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-201ENST00000298838 MDFICQ9P1T7 246 aa15.07■□□□□ 0
PACSIN3-201ENST00000298838 MT-ND6P03923 174 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-201ENST00000298838 TWIST1Q15672 202 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-201ENST00000298838 MGAM2Q2M2H8 2515 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-201ENST00000298838 HLA-DQA1P01909 254 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM136Q6ZRR5 245 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-201ENST00000298838 C9orf85Q96MD7 179 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-201ENST00000298838 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15.06■□□□□ 0
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 TRGC2P03986 189 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 FRZBQ92765 325 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 NOTCH1P46531 2555 aa15.05■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 A8MZ25 164 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 PRM2P04554 102 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF415Q09FC8 603 aa15.04■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 M0R381 172 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2CO00762 179 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFP82Q8N141 532 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 MSRB1Q9NZV6 116 aa15.03■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 MUC4Q99102 2169 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 SPRY2O43597 315 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 FABP9Q0Z7S8 132 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 GATD1Q8NB37 220 aa15.02■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf196B1AJZ1 125 aa15.01□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 NXPH4O95158 308 aa15.01□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.01□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF493Q6ZR52 646 aa15.01□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.01□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 AZU1P20160 251 aa15□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 RRN3P1Q2M238 152 aa15□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 DEFB135Q30KP9 77 aa15□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 SYT8Q8NBV8 401 aa15□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 SLAQ13239 276 aa14.99□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.99□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.99□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 RCHY1Q96PM5 261 aa14.99□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.99□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 APCSP02743 223 aa14.99□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 TRGC1P0CF51 173 aa14.99□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 C16orf74Q96GX8 76 aa14.99□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB5BP61020 215 aa14.98□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 SPXQ9BT56 116 aa14.98□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 M0R2P5 195 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 PHOX2AO14813 284 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF876PQ49A33 203 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 Q6ZWC4 215 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 AP1S3Q96PC3 154 aa14.97□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 EVI2AP22794 236 aa14.96□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.96□□□□□ -0.01
PACSIN3-201ENST00000298838 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 AMN1Q8IY45 258 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 IL17DQ8TAD2 202 aa14.95□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 PTH2Q96A98 100 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 X6R8D5 127 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF183Q96D59 192 aa14.94□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2BKO60814 126 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2BJP06899 126 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2BOP23527 126 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2BBP33778 126 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2BDP58876 126 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2BCP62807 126 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 OR11H2Q8NH07 326 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 K7EIL1 84 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM17P0DL12 118 aa14.92□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB4AP20338 218 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 RASL10AQ92737 203 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF185Q96GF1 192 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 JPT2Q9H910 190 aa14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PACSIN3-201ENST00000298838 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-201ENST00000298838 LGALS9BQ3B8N2 356 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-201ENST00000298838 A8MWV9 139 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-201ENST00000298838 SRIP30626 198 aa14.89□□□□□ -0.03
PACSIN3-201ENST00000298838 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms