RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01600Q96MT4 127 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 NMES1Q9C002 83 aa5.07□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM262E9PQX1 116 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 OR7C2O60412 319 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DQA1P01909 254 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF7P21781 194 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 TAS2R45P59539 299 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL16Q0P5N6 197 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 CTF1Q16619 201 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP69Q49AA0 526 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 PYDC2Q56P42 97 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 PTH2Q96A98 100 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00479Q96M42 142 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 TREM1Q9NP99 234 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.06□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 LRP2P98164 4655 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L23D6RBM5 183 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 RHODO00212 210 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 NOL3O60936 208 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 CST7O76096 145 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 SULT1A1P50225 295 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 MIAQ16674 131 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR73Q6P4I2 378 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0J9YXV3 536 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPXA8MT69 81 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EQM0 130 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A10P60903 97 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 KHDC3LQ587J8 217 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 HYLS1Q96M11 299 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 OTORQ9NRC9 128 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF213Q63HN8 5207 aa5.04□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 FXYD5Q96DB9 178 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 PARLQ9H300 379 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM25EA8MYX2 175 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 F6UZH7 168 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFB6O95139 128 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00694P0DN24 101 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A5P33763 92 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf85Q96MD7 179 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WYN8 130 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 PHOX2AO14813 284 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS1P07477 247 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 SMUG1Q53HV7 270 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIQKQ629K1 86 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 MITD1Q8WV92 249 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 GTSF1Q8WW33 167 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM63Q969Q1 353 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 hDV102S1A0JD36 115 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 GZMBP10144 247 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 SPCS2Q15005 226 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-201ENST00000296642 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms