RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6AWC8 147 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 AMTNQ6UX39 209 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GUT8 65 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-DQA1P01909 254 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 KNCNA6PVL3 124 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 CTRLP40313 264 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 MUC21Q5SSG8 566 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 ODF3Q96PU9 254 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 SAP30O75446 220 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 CITED1Q99966 193 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 M0R2Z0 102 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 IGLV1-51P01701 117 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 CDKN1BP46527 198 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 ODF1Q14990 250 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 A8MTW9 85 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4C46A6NHA9 309 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 H3BMM0 161 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 APCSP02743 223 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-DRB4P13762 266 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 CNFNQ9BYD5 112 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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RABGEF1-201ENST00000284957 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 GATD1Q8NB37 220 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 RIGQ13278 110 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2V1Q13404 147 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM238C9JI98 176 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 PF4P02776 101 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 LEPP41159 167 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 C7orf71A4D174 169 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-201ENST00000284957 H0Y8G0 127 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-201ENST00000284957 MUC4Q99102 2169 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GW15 77 aa6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-201ENST00000284957 H3BVH4 76 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRY2O43597 315 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 TWIST1Q15672 202 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 BORCS7Q96B45 105 aa6.88□□□□□ -1.31
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RABGEF1-201ENST00000284957 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPOP30536 169 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 TCTAP57738 103 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 CST9LQ9H4G1 147 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 COX11Q9Y6N1 276 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 OR11H12B2RN74 326 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 AMN1Q8IY45 258 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 RCHY1Q96PM5 261 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-201ENST00000284957 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.86□□□□□ -1.31
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