RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266254.11

TTLL1-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTLL1, Length 1,645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-201ENST00000266254 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 CACNG7P62955 275 aa16.51■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 TMEM136Q6ZRR5 245 aa16.51■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 C1orf158Q8N1D5 194 aa16.51■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa16.5■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 MUC21A0A140T8X8 626 aa16.5■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 HLA-DQA1P01909 254 aa16.5■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 TRGC2P03986 189 aa16.5■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.5■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.49■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 HTN1P15515 57 aa16.49■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 NTF3P20783 257 aa16.49■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 OR10AG1Q8NH19 301 aa16.49■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16.49■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 APOC4P55056 127 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 SSTP61278 116 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 TWIST1Q15672 202 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 SPANXN1Q5VSR9 72 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 FRZBQ92765 325 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 C9orf85Q96MD7 179 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 MDFICQ9P1T7 246 aa16.48■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa16.47■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 FABP9Q0Z7S8 132 aa16.47■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 GATD1Q8NB37 220 aa16.47■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TTLL1-201ENST00000266254 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF415Q09FC8 603 aa16.45■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 MUC4Q99102 2169 aa16.45■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 RAB5BP61020 215 aa16.45■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF493Q6ZR52 646 aa16.45■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 ZFP82Q8N141 532 aa16.45■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 MSRB1Q9NZV6 116 aa16.45■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 M0R381 172 aa16.44■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 PHOX2AO14813 284 aa16.44■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 APCSP02743 223 aa16.44■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 NXPH4O95158 308 aa16.43■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 A8MZ25 164 aa16.42■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 PRM2P04554 102 aa16.42■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 SMIM15Q7Z3B0 74 aa16.42■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 TMEM191AQ9H0A3 160 aa16.42■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 UBE2CO00762 179 aa16.41■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 SPRY2O43597 315 aa16.41■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 SLAQ13239 276 aa16.41■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 SBSPONQ8IVN8 264 aa16.41■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 C11orf72Q8NBR9 251 aa16.41■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 SYT8Q8NBV8 401 aa16.41■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 COL7A1Q02388 2944 aa16.41■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 TRGC1P0CF51 173 aa16.41■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 AZU1P20160 251 aa16.4■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 DMRTA1Q5VZB9 504 aa16.4■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 SPXQ9BT56 116 aa16.4■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa16.4■□□□□ 0.22
TTLL1-201ENST00000266254 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 RCHY1Q96PM5 261 aa16.39■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 RRN3P1Q2M238 152 aa16.38■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 C16orf74Q96GX8 76 aa16.38■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 U3KQK5 164 aa16.38■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 FAM104BQ5XKR9 115 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 AP1S3Q96PC3 154 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 M0R2P5 195 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST1H2BKO60814 126 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST1H2BJP06899 126 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST1H2BOP23527 126 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST1H2BBP33778 126 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST1H2BDP58876 126 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST1H2BCP62807 126 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST2H2BEQ16778 126 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 KIAA1644Q3SXP7 199 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST1H2BHQ93079 126 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 PTH2Q96A98 100 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST1H2BNQ99877 126 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 HIST1H2BMQ99879 126 aa16.37■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 EVI2AP22794 236 aa16.36■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 ZNF876PQ49A33 203 aa16.36■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 AMN1Q8IY45 258 aa16.36■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 SMIM9A6NGZ8 99 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 DEFB135Q30KP9 77 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 IL17DQ8TAD2 202 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 ZMAT4Q9H898 229 aa16.35■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 Q6ZWC4 215 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16.34■□□□□ 0.21
TTLL1-201ENST00000266254 SMIM17P0DL12 118 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-201ENST00000266254 RAB4AP20338 218 aa16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-201ENST00000266254 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
TTLL1-201ENST00000266254 SRIP30626 198 aa16.32■□□□□ 0.2
TTLL1-201ENST00000266254 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms