RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.51□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 SOCS3O14543 225 aa7.51□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 GPHB5Q86YW7 130 aa7.51□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 TPPP3Q9BW30 176 aa7.51□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 A0A1B0GV72 72 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 TMEM219Q86XT9 240 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 PCP2Q8IVA1 136 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 F8W1H4 67 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 NDUFA4O00483 81 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 NPYP01303 97 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 SMPXQ9UHP9 88 aa7.5□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 AZU1P20160 251 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 CFHR3Q02985 330 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 TWIST1Q15672 202 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 USMG5Q96IX5 58 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 IGLV1-40P01703 118 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 GCSHP23434 173 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.49□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 HLA-DRB4P13762 266 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 CKS2P33552 79 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 ORM1P02763 201 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 DUX5Q96PT3 197 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 TM2D2Q9BX73 214 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.48□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 TRGV3P03979 118 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 ARL3P36405 182 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 C20orf173Q96LM9 149 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 ZMAT4Q9H898 229 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.47□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.46□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 LY6G6DO95868 133 aa7.46□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 TRBV12-3P01733 135 aa7.46□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 FXYD2P54710 66 aa7.46□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.46□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 DKK2Q9UBU2 259 aa7.46□□□□□ -1.21
PDCL-201ENST00000259467 E9PLD3 99 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 SMKR1H3BMG3 65 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 EVI2AP22794 236 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 TCTAP57738 103 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 TAL2Q16559 108 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 LINC00477Q96M19 166 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 SPATA25Q9BR10 227 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 GAS8-AS1O95177 125 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 FCER1GP30273 86 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 TM4SF20Q53R12 229 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 PRR9Q5T870 116 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 CEND1Q8N111 149 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 ATP5LO75964 103 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 TNFRSF6BO95407 300 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 IGKCP01834 107 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 ODF1Q14990 250 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 NRACQ8N912 160 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 H3BUX3 64 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 OVOL1O14753 267 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 GATA3P23771 443 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 LY6EQ16553 131 aa7.45□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 DPM2O94777 84 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 MED14OSP0DP75 135 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 FXYD7P58549 80 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 Q8N8P6 123 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 C16orf92Q96LL3 132 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 KLK15Q9H2R5 256 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 PRSS1P07477 247 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 LEPP41159 167 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 Q6ZS46 218 aa7.44□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 IGLL5B9A064 214 aa7.43□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 K7EMT4 169 aa7.43□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 K7ERJ3 54 aa7.43□□□□□ -1.22
PDCL-201ENST00000259467 BLCAPP62952 87 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms