RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mlst8Q9DCJ1 326 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tnfrsf13bQ9ET35 249 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ssna1Q9JJ94 119 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ovol1Q9WTJ2 267 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ctxnd1A0A1B0GST9 59 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P01726 129 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Csn1s2bP02664 143 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 4933415F23RikQ14BX6 153 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 KcnrgQ2TUM3 264 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Spsb3Q571F5 354 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vstm2aQ8R0A6 236 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn1r62Q8R2C0 300 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mogat1Q91ZV4 335 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hsd17b6Q9R092 317 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ptpn13Q64512 2453 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv4-1A0A075B5R5 116 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv1-67A0A0G2JFN9 117 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rhox10Q4TU83 196 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Neil2Q6R2P8 329 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zc2hc1aQ8BJH1 324 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q9CRC3 126 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AmtnQ9D3J8 213 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 2200002J24RikQ9D807 110 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SonQ9QX47 2444 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ighv8-9A0A0G2JET1 119 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ifna5P07349 189 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mcrip1Q3UGS4 97 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav8d-1Q5R1H8 112 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm5771Q792Y9 245 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ErasQ7TN89 227 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Commd5Q8R395 224 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Chrdl1Q920C1 447 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Map1lc3bQ9CQV6 125 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hspb9Q9DAM3 168 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dram1Q9DC58 238 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Timm23Q9WTQ8 209 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 BC053393A0A0B4J1F6 192 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1700015F17RikD3YUK8 150 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr191L7N1Z8 309 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Defa11P50709 85 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm26566Q8CAC1 153 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppp1r14aQ91VC7 147 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Errfi1Q99JZ7 461 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Try5Q9QUK9 246 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Try4Q9R0T7 246 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SnapinQ9Z266 136 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gpr132Q9Z282 382 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm28171A0A087WQ19 227 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr364-ps1A0A140T8Q2 307 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm37988J3QM41 62 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ppt1O88531 306 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ifna4P07351 186 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 S100a1P56565 94 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zfp970Q08BU3 522 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Klf14Q19A41 325 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf126Q91YL2 313 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Efcab10Q9D581 132 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rgs21V9GXQ3 152 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Wnt2bO70283 389 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Psmb6Q60692 238 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fam168aQ8BGZ2 244 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 COA4Q8BT51 87 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr1454Q8VFW2 307 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Glo1Q9CPU0 184 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ms4a4cQ9D3F6 226 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm14412A2ARR7 526 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 P06323 132 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SlpiP97430 131 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vwc2lQ505H4 222 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sdr39u1Q5M8N4 308 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 MiaQ61865 130 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Srsf1Q6PDM2 248 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ell3Q80VR2 395 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr346Q8VGJ7 309 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 4933414I15RikQ9D4D5 133 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 HeylQ9DBX7 326 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Vmn1r50Q9EP51 310 aa16.04■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr913E9Q716 312 aa16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr893K7N678 312 aa16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nup62Q63850 526 aa16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr480Q8VEZ0 312 aa16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr491Q8VG06 310 aa16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Etfrf1Q91V16 86 aa16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pth2Q91W27 100 aa16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tmem170aQ9D342 144 aa16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 VsirQ9D659 308 aa16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Btbd17Q9DB72 478 aa16.03■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ash1lQ99MY8 2958 aa16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trav17A0A075B655 113 aa16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ube2e1P52482 193 aa16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr147Q60886 317 aa16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nars2Q8BGV0 477 aa16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rnf182Q8C432 247 aa16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Olfr211Q8VGH2 309 aa16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Scp2d1Q9DAH1 156 aa16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Aurkaip1Q9DCJ7 200 aa16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyb5r3Q9DCN2 301 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pla2g2dQ9WVF6 144 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 1202.7 ms