Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB72

Btbd17, BTB/POZ domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd17Q9DB72 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Btbd17Q9DB72 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Btbd17Q9DB72 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Btbd17Q9DB72 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Btbd17Q9DB72 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Btbd17Q9DB72 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Btbd17Q9DB72 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Btbd17Q9DB72 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,11■■□□□ 1,77
Btbd17Q9DB72 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Btbd17Q9DB72 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Btbd17Q9DB72 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Btbd17Q9DB72 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Btbd17Q9DB72 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Btbd17Q9DB72 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Btbd17Q9DB72 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Btbd17Q9DB72 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Btbd17Q9DB72 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Btbd17Q9DB72 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Btbd17Q9DB72 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Btbd17Q9DB72 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Btbd17Q9DB72 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Btbd17Q9DB72 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Btbd17Q9DB72 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Btbd17Q9DB72 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Btbd17Q9DB72 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,37■■□□□ 1,49
Btbd17Q9DB72 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,32■■□□□ 1,48
Btbd17Q9DB72 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Btbd17Q9DB72 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,19■■□□□ 1,46
Btbd17Q9DB72 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Btbd17Q9DB72 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Btbd17Q9DB72 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Btbd17Q9DB72 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Btbd17Q9DB72 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Btbd17Q9DB72 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Btbd17Q9DB72 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Btbd17Q9DB72 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
Btbd17Q9DB72 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Btbd17Q9DB72 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Btbd17Q9DB72 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Btbd17Q9DB72 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Btbd17Q9DB72 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Btbd17Q9DB72 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Btbd17Q9DB72 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Btbd17Q9DB72 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Btbd17Q9DB72 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Btbd17Q9DB72 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Btbd17Q9DB72 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,7■■□□□ 1,38
Btbd17Q9DB72 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,69■■□□□ 1,38
Btbd17Q9DB72 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Btbd17Q9DB72 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Btbd17Q9DB72 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Btbd17Q9DB72 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Btbd17Q9DB72 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Btbd17Q9DB72 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Btbd17Q9DB72 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Btbd17Q9DB72 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Btbd17Q9DB72 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Btbd17Q9DB72 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,24■■□□□ 1,31
Btbd17Q9DB72 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Btbd17Q9DB72 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Btbd17Q9DB72 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Btbd17Q9DB72 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Btbd17Q9DB72 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Btbd17Q9DB72 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
Btbd17Q9DB72 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Btbd17Q9DB72 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Btbd17Q9DB72 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Btbd17Q9DB72 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,06■■□□□ 1,28
Btbd17Q9DB72 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Btbd17Q9DB72 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Btbd17Q9DB72 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1,27
Btbd17Q9DB72 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Btbd17Q9DB72 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Btbd17Q9DB72 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Btbd17Q9DB72 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Btbd17Q9DB72 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,9■■□□□ 1,26
Btbd17Q9DB72 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Btbd17Q9DB72 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Btbd17Q9DB72 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Btbd17Q9DB72 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Btbd17Q9DB72 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Btbd17Q9DB72 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,23
Btbd17Q9DB72 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22,73■■□□□ 1,23
Btbd17Q9DB72 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Btbd17Q9DB72 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Btbd17Q9DB72 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Btbd17Q9DB72 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Btbd17Q9DB72 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Btbd17Q9DB72 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Btbd17Q9DB72 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Btbd17Q9DB72 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Btbd17Q9DB72 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Btbd17Q9DB72 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22,52■■□□□ 1,2
Btbd17Q9DB72 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Btbd17Q9DB72 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Btbd17Q9DB72 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Btbd17Q9DB72 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Btbd17Q9DB72 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,42■■□□□ 1,18
Btbd17Q9DB72 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Btbd17Q9DB72 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,8 ms