Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Ifna5P07349 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Ifna5P07349 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Ifna5P07349 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Ifna5P07349 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Ifna5P07349 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ifna5P07349 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ifna5P07349 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Ifna5P07349 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Ifna5P07349 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Ifna5P07349 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Ifna5P07349 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Ifna5P07349 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
Ifna5P07349 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Ifna5P07349 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Ifna5P07349 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
Ifna5P07349 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Ifna5P07349 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,2■■□□□ 1,46
Ifna5P07349 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Ifna5P07349 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Ifna5P07349 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Ifna5P07349 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ifna5P07349 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Ifna5P07349 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,72■■□□□ 1,39
Ifna5P07349 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ifna5P07349 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ifna5P07349 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ifna5P07349 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Ifna5P07349 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Ifna5P07349 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ifna5P07349 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ifna5P07349 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ifna5P07349 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ifna5P07349 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ifna5P07349 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ifna5P07349 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,39■■□□□ 1,34
Ifna5P07349 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Ifna5P07349 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ifna5P07349 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Ifna5P07349 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
Ifna5P07349 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Ifna5P07349 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Ifna5P07349 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ifna5P07349 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ifna5P07349 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ifna5P07349 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ifna5P07349 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ifna5P07349 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Ifna5P07349 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Ifna5P07349 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ifna5P07349 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ifna5P07349 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ifna5P07349 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ifna5P07349 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ifna5P07349 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ifna5P07349 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ifna5P07349 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22,74■■□□□ 1,23
Ifna5P07349 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ifna5P07349 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,66■■□□□ 1,22
Ifna5P07349 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Ifna5P07349 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Ifna5P07349 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ifna5P07349 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ifna5P07349 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,6■■□□□ 1,21
Ifna5P07349 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,59■■□□□ 1,21
Ifna5P07349 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Ifna5P07349 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Ifna5P07349 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ifna5P07349 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ifna5P07349 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ifna5P07349 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ifna5P07349 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Ifna5P07349 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Ifna5P07349 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Ifna5P07349 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Ifna5P07349 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ifna5P07349 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ifna5P07349 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,31■■□□□ 1,16
Ifna5P07349 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,29■■□□□ 1,16
Ifna5P07349 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Ifna5P07349 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Ifna5P07349 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Ifna5P07349 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Ifna5P07349 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Ifna5P07349 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Ifna5P07349 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Ifna5P07349 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Ifna5P07349 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Ifna5P07349 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Ifna5P07349 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ifna5P07349 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ifna5P07349 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Ifna5P07349 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ifna5P07349 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Ifna5P07349 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Ifna5P07349 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Ifna5P07349 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
Ifna5P07349 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ifna5P07349 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Ifna5P07349 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21,76■■□□□ 1,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,9 ms