RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr223Q8VF69 319 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1368Q8VFG3 314 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr786Q8VFH8 312 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rab27bQ99P58 218 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam96bQ9D187 163 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4930583I09RikQ9D2E3 102 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Efcab10Q9D581 132 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf125Q9D9R0 233 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mettl9Q9EPL4 318 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cxcr6Q9EQ16 351 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Try5Q9QUK9 246 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Try4Q9R0T7 246 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Defb3Q9WTL0 63 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FaimQ9WUD8 179 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tusc2Q9WVF8 110 aa7.51□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FlncQ8VHX6 2726 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cmya5Q70KF4 3739 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dscaml1Q4VA61 2053 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv1-7A0A075B5T7 117 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ighv1-81A0A075B5Y4 117 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trbv19A0A0B4J1H4 117 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm45800A0A1B0GT24 152 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Frrs1lB1AXV0 293 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm21974F6W3F3 119 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mex3aG3UYU0 520 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm20873J3QMQ9 232 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm20795J3QP49 232 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm21310J3QQ23 232 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm27021M0QWE2 156 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P01726 129 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P04212 136 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssty1P13675 232 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rps16P14131 146 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fli1P26323 452 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Svs5P30933 122 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bmpr1bP36898 502 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cox7a2P48771 83 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spam1P48794 512 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FmodP50608 376 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Npas1P97459 594 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gata4Q08369 441 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm773Q3TML4 206 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm21440Q3TTD8 232 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Patz1Q5NBY9 687 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr323Q5NCD0 323 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dlx1Q64317 255 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5771Q792Y9 245 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 LgalslbQ7TPX9 165 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1042Q7TR81 313 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr138Q7TRI7 312 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 BsxQ810B3 232 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smco3Q8BQM7 225 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Foxn4Q8K3Q3 521 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1202Q8VF98 309 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1272Q8VGN8 308 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pbp2Q8VIN1 187 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp6v0bQ91V37 205 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ms4a3Q920C4 213 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RhebQ921J2 184 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp958Q99LG7 467 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sft2d3Q9CSV6 209 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssbp3Q9D032 388 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4933407L21RikQ9D476 131 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eaf1Q9D4C5 268 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GlrxQ9QUH0 107 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxl17Q9QZN1 701 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vax2Q9WTP9 292 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PkdrejQ9Z0T6 2126 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Supt4h1bQ9Z199 117 aa7.5□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm28372A0A087WNV0 220 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scgb1b24B1B0N6 92 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3618D3Z4P5 127 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nkx6-2D3Z4R4 277 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Inafm1E9PV59 130 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5819E9PZ96 154 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm5108J3QP01 101 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10665K7N6B7 321 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fgfbp1O70514 251 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ifitm5O88728 134 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cst7O89098 144 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccl2P10148 148 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ApcsP12246 224 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp5g2P56383 146 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vkorc1l1Q6TEK5 176 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Scgb2b24Q7M747 112 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr275Q7TS18 319 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 H2-M10.6Q85ZW5 330 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr112Q8C0S2 320 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Commd5Q8R395 224 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1475Q8VEV6 314 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1183Q8VFF8 303 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr513Q8VFZ3 309 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr346Q8VGJ7 309 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf126Q91YL2 313 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Acaa1aQ921H8 424 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem107Q9CPV0 140 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hint2Q9D0S9 163 aa7.49□□□□□ -1.21
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mlst8Q9DCJ1 326 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30 ms