RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055131.12

Usp48-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp48, Length 5,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48-201ENSMUST00000055131 Col4a3Q9QZS0 1669 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Khdc1cQ4KL78 166 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rnase2aQ8K196 155 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 AY761184Q9D848 116 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Zfp983E9PUT0 460 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ssbp4Q3U4B1 363 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fam117aQ7TNF9 451 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ndufs8Q8K3J1 212 aa14.65□□□□□ -0.06
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pcm1Q9R0L6 2025 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm10665K7N6B7 321 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 2210407C18RikQ6YI28 220 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Smim19Q80ZU4 107 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 SmpxQ9DC77 85 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ighv9-3A0A0B4J1J5 117 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 OdamA1E960 273 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm21719J3KMI9 230 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ca2P00920 260 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc16a4Q8R0M8 500 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Atp5lQ9CPQ8 103 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ighv5-9A0A075B5Q2 117 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 eef1akmt3D3YWP0 232 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prss32E9Q409 334 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Xaf1Q5NBU8 273 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ndufa7Q9Z1P6 113 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 H2-Ab1P01921 265 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 GfralQ6SJE0 393 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 3100002H09RikQ9CXW6 140 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Reg4Q9D8G5 157 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pf4Q9Z126 105 aa14.64□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tcrg-C2A0A075B5Z2 167 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 1700020N15RikL7MTX3 112 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 P01634 136 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 P01853 167 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Bhlha15Q9QYC3 197 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm16442D3YZG3 307 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm14548E9Q1Z6 680 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr399Q7TRX3 311 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm10130F6ZHM5 101 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Smr2O09133 150 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Adrb3P25962 400 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mob4Q6PEB6 225 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Efemp2Q9WVJ9 443 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 IcosQ9WVS0 200 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gata2O09100 480 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Bud31Q6PGH1 103 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 PgpQ8CHP8 321 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Mrps36Q9CQX8 102 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Prr15Q9D1T5 122 aa14.63□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Trav6d-4Q5R1I0 115 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Cd200r5Q8BTP3 270 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 St6galnac3Q9WUV2 305 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm44973A0A140LJJ1 189 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Igsf23B2RTN2 239 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Slc25a35Q5SWT3 300 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Col13a1Q9R1N9 751 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dock11A2AF47 2073 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Malrd1A2AJX4 2123 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tcf15Q60756 195 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Dtx2Q8R3P2 619 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pappa2E9PZ87 1789 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ly75Q60767 1723 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Frrs1lB1AXV0 293 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 CampP51437 172 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm11232Q5SPI8 295 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm10118Q8C8J5 116 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Scn2aA0A0J9YTW6 2006 aa14.62□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Ifitm7G3X9Z2 141 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 P01801 115 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem219Q9D123 240 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 HrkP62816 92 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Megf10Q6DIB5 1147 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Wdr82Q8BFQ4 313 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Iglv3A0A0B4J1K5 122 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 NrtnP97463 195 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Defb33Q30KN3 62 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Fam162bQ9CX19 157 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sfrp4Q9Z1N6 351 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 CebpbP28033 296 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 St6galnac2P70277 373 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Asphd1Q2TA57 360 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem50aQ9CXL1 157 aa14.61□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 AsmtD3KU66 387 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 1700015F17RikD3YUK8 150 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Pax8Q00288 457 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Rasl11aQ6IMB1 242 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Q8VC23 124 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr491Q8VG06 310 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Tmem101Q91VP7 257 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm21789J3QMZ1 123 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm21870J3QPN2 123 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm21883J3QPV3 123 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sc5dO88822 299 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Vmn1r235Q8R297 328 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Sumo3Q9Z172 110 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Adamts17E9Q4D1 1122 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Gm5150Q1AN92 299 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 St6galnac6Q9JM95 333 aa14.6□□□□□ -0.07
Usp48-201ENSMUST00000055131 Olfr918E9PVZ7 325 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 115.5 ms