RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617649.4

ACACA-240, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 5 BASIC

Gene ACACA, Length 7,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-240	ENST00000617649	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	NDUFS7	O75251	213 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	ESD	P10768	282 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	SPRY4	Q9C004	299 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	VOPP1	Q96AW1	172 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	PRO3102	Q9H379	93 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	MMP23A	O75900	390 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	CD5L	O43866	347 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	NPC2	P61916	151 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	UBE2B	P63146	152 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	GAGE6	Q13070	117 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	C20orf78	Q9BR46	151 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	HLA-DRB4	P13762	266 aa		5.21	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		5.21	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		5.21	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649		H3BUT2	72 aa		5.21	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	SLURP1	P55000	103 aa		5.21	□□□□□ -1.57
ACACA-240	ENST00000617649	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	PIFO	Q8TCI5	191 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	DEFB136	Q30KP8	78 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	GAGE2E	Q4V326	116 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	TM2D2	Q9BX73	214 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	ATP5G1	P05496	136 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	CRLF1	O75462	422 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	SMKR1	H3BMG3	65 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649		K7EMT4	169 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649		Q8NA96	180 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	FXYD5	Q96DB9	178 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649		Q6ZWC4	215 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	GAGE2B	Q13066	116 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	GUSBP1	Q15486	140 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649		U3KQE9	123 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	GPHB5	Q86YW7	130 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	LINC00479	Q96M42	142 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF843	Q8N446	348 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	ZNF524	Q96C55	264 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649		K7EQD1	137 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	CXCL1	P09341	107 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	C2orf70	A6NJV1	201 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	LTA	P01374	205 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	IGHG2	P01859	326 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		5.19	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	TMEM213	A2RRL7	107 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	IGKV1-39	P01597	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	IGKV1D-39	P04432	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649		Q6ZSR3	168 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	FSTL3	O95633	263 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649		Q8N9W7	124 aa		5.18	□□□□□ -1.58
ACACA-240	ENST00000617649	NRGN	Q92686	78 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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