RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.11■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 SFRP2Q96HF1 295 aa15.11■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 NAGKQ9UJ70 344 aa15.11■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.11■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 V9GYV3 84 aa15.11■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 ORM1P02763 201 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 RCHY1Q96PM5 261 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 TM2D3Q9BRN9 247 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 PYGO2Q9BRQ0 406 aa15.1■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 P01737 135 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 TYMSP04818 313 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 ERVFC1-1P60608 527 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 RNF212Q495C1 297 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 OR10G8Q8NGN5 311 aa15.09■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.08■□□□□ 0.01
CSAG3-202ENST00000617158 GRIFINA4D1Z8 144 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 B4DEV8 164 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 SPRY2O43597 315 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 GATCO43716 136 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 ATP6V1G1O75348 118 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 GZMBP10144 247 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 FAM159AQ6UWV7 190 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 OR2D3Q8NGH3 330 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 NEU1Q99519 415 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 MDFICQ9P1T7 246 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa15.08■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa15.07■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 PLAC8L1A1L4L8 177 aa15.07■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM189A5PLL7 270 aa15.07■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.07■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 OR11H2Q8NH07 326 aa15.07■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 B9D2Q9BPU9 175 aa15.07■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 DNAH9Q9NYC9 4486 aa15.06■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 C7orf77A4D0Y5 90 aa15.06■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 HTN1P15515 57 aa15.06■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 DNLZQ5SXM8 178 aa15.06■□□□□ 0
CSAG3-202ENST00000617158 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 SVBPQ8N300 66 aa15.05■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 CBY3A6NI87 242 aa15.04■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 CXCL1P09341 107 aa15.04■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 CT83Q5H943 113 aa15.04■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.04■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 Q8NAQ8 132 aa15.04■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 IL17DQ8TAD2 202 aa15.04■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 GTSF1Q8WW33 167 aa15.04■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 KCNS1Q96KK3 526 aa15.04■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 TENM3Q9P273 2699 aa15.03■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 MUC4Q99102 2169 aa15.03■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 IGLC6P0CF74 106 aa15.03■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15.02■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 SMIM9A6NGZ8 99 aa15.02■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 MT-ND4LP03901 98 aa15.02■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 RHEBQ15382 184 aa15.02■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 RRN3P1Q2M238 152 aa15.02■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 C9orf85Q96MD7 179 aa15.02■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.02■□□□□ -0
CSAG3-202ENST00000617158 SNAPINO95295 136 aa15.01□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 RPS20P60866 119 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 TSKUQ8WUA8 353 aa15.01□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 ANAPC16Q96DE5 110 aa15.01□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 SPATA25Q9BR10 227 aa15.01□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 SCRT2Q9NQ03 307 aa15.01□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 TRGV11A0A075B6L2 103 aa15□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 A0A087WWC5 75 aa15□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 A8MWL6 223 aa15□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1R2P9O14990 202 aa15□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 ARMS2P0C7Q2 107 aa15□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 ASIPP42127 132 aa15□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 H3BVH4 76 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 DEFB4AO15263 64 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 SNAI2O43623 268 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 MIFP14174 115 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 TCL1AP56279 114 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 CTDSP1Q9GZU7 261 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 RPS10P5Q9NQ39 176 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 IL36BQ9NZH7 164 aa14.99□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 C16orf74Q96GX8 76 aa14.98□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.97□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.97□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF415Q09FC8 603 aa14.97□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.97□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 GFRA4Q9GZZ7 299 aa14.97□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 OR5AL1P0C617 328 aa14.96□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 MED14OSP0DP75 135 aa14.96□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 S100A1P23297 94 aa14.96□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 CTRLP40313 264 aa14.96□□□□□ -0.01
CSAG3-202ENST00000617158 LYZL1Q6UWQ5 148 aa14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms