RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 KIR3DS1Q14943 382 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 ODF3L2Q3SX64 289 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 DNLZQ5SXM8 178 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM110AQ9BQ89 295 aa16.87■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 APCSP02743 223 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 CDKN1BP46527 198 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 CAMPP49913 170 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 BEAN1Q3B7T3 259 aa16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIFINA4D1Z8 144 aa16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 J3KRW8 73 aa16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFA6P56556 154 aa16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 SNAI2O43623 268 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 MED14OSP0DP75 135 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF493Q6ZR52 646 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 WNK1Q9H4A3 2382 aa16.84■□□□□ 0.29
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2CO00762 179 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 OR5AL1P0C617 328 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXA5P20719 270 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 INSL3P51460 131 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 SLAQ13239 276 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 GFI1BQ5VTD9 330 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 TPPP3Q9BW30 176 aa16.83■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 IGKV3-20P01619 116 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 TDRG1Q3Y452 100 aa16.82■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 OR11H12B2RN74 326 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF124Q15973 351 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 SPINK13Q1W4C9 94 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNS1Q96KK3 526 aa16.81■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 SORL1Q92673 2214 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R2Z0 102 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNG7P62955 275 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 NAGKQ9UJ70 344 aa16.8■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 ASIPP42127 132 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 Q0VG73 95 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF747Q9BV97 191 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 AGRNO00468 2067 aa16.79■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 CRXO43186 299 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 MUC21Q5SSG8 566 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 C19orf73Q9NVV2 129 aa16.78■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 AMBPP02760 352 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 NTF3P20783 257 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1644Q3SXP7 199 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM159AQ6UWV7 190 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 WFDC9Q8NEX5 89 aa16.77■□□□□ 0.28
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 TWIST1Q15672 202 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10J3Q5JRS4 329 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 DMRTA1Q5VZB9 504 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 PRIMA1Q86XR5 153 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM191AQ9H0A3 160 aa16.76■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 GNRH2O43555 120 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 SRIP30626 198 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 C20orf144Q9BQM9 153 aa16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BVH4 76 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 RIPPLY3P57055 190 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM104BQ5XKR9 115 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 STHQ8IWL8 128 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 HIST3H2BBQ8N257 126 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10AG1Q8NH19 301 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.74■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 JMJD1CQ15652 2540 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 MUC21A0A140T8X8 626 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 CD7P09564 240 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA3Q8NHX4 192 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa16.73■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 NXPH4O95158 308 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 RBMY1CP0DJD4 496 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 FXYD7P58549 80 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 MSRB1Q9NZV6 116 aa16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.72■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 ESDP10768 282 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 U3KQK5 164 aa16.71■□□□□ 0.27
CAPNS1-207ENST00000589146 IFITM10A6NMD0 228 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 WIPF1O43516 503 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 SPANXN1Q5VSR9 72 aa16.7■□□□□ 0.26
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf85Q96MD7 179 aa16.7■□□□□ 0.26
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