RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 INSP01308 110 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 CXCL6P80162 114 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 FAM120AOSQ5T036 256 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 C20orf197Q8N268 126 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 CLPSL1A2RUU4 121 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 CRYGAP11844 174 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2E2Q96LR5 201 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 EFNA2O43921 213 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-11P01762 117 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 APELAP0DMC3 54 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 MYCNOSP40205 109 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 LHFPL1Q86WI0 220 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV3A0A0B4J244 114 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 RPL39P5Q59GN2 51 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 MIC13Q5XKP0 118 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 BRD3OSQ6XYD6 125 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 HELZP42694 1942 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 LYPD3O95274 346 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 DOCK8Q8NF50 2099 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 LEAP2Q969E1 77 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 GPHA2Q96T91 129 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 OTORQ9NRC9 128 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC88CQ9P219 2028 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 LGALS9O00182 355 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 SMKR1H3BMG3 65 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 FSHBP01225 129 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 ARID1AO14497 2285 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 ALPK2Q86TB3 2170 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 HTN3P15516 51 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF747Q9BV97 191 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 CDIP1Q9H305 208 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 UTRNP46939 3433 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 DOCK4Q8N1I0 1966 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf38Q86SI9 138 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 ANAPC10Q9UM13 185 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 PSCAO43653 123 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 LAGE3Q14657 143 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZS49 121 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 PCP2Q8IVA1 136 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 LYZL4Q96KX0 146 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFS7O75251 213 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 MORN5Q5VZ52 161 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 Q9H3A6 140 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 PROK2Q9HC23 129 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 PIFOQ8TCI5 191 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 HIVEP2P31629 2446 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 FSTL3O95633 263 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRDP23468 1912 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 C15orf32Q32M92 178 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 KLK15Q9H2R5 256 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 V9GYV3 84 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 NXPH4O95158 308 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 DKK2Q9UBU2 259 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-210ENST00000551525 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 CD177Q8N6Q3 437 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 C15orf62A8K5M9 175 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 PAX4O43316 350 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TCL1BO95988 128 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 FGFBP3Q8TAT2 258 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 LIME1Q9H400 295 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA4O00483 81 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TFF3Q07654 80 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 RHOHQ15669 191 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA11Q86Y39 141 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ESM1Q9NQ30 184 aa4.95□□□□□ -1.62
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