RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526207.1

TXNRD1-210, Transcript of thioredoxin reductase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TXNRD1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1-210ENST00000526207 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.62□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 GPX1P07203 203 aa4.62□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 SELENOTP62341 195 aa4.62□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa4.62□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 RAB26Q9ULW5 256 aa4.62□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.62□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa4.62□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 MUC2Q02817 5179 aa4.62□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 DISC1C4P0D8 188 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 K7EPK0 472 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 NDUFB4O95168 129 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 TDRG1Q3Y452 100 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 OCC1Q8TAD7 63 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 Q8TAT8 98 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 RAB2BQ8WUD1 216 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 RASL10AQ92737 203 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 SOSTQ9BQB4 213 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 PAXXQ9BUH6 204 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 MIXL1Q9H2W2 232 aa4.61□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 AGPAT2O15120 278 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 COX7A2P2O60397 106 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 MED6O75586 246 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 AKAIN1P0CW23 69 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 BCAP31P51572 246 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 ARL16Q0P5N6 197 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 VAMP3Q15836 100 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 Q8N976 141 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 MGST2Q99735 147 aa4.6□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 HOXB5P09067 269 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 METTL15P1P0C7V9 234 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 PYYP10082 97 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 SLC25A6P12236 298 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 PRRT1Q99946 306 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 SRRQ9GZT4 340 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 NPVFQ9HCQ7 196 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 BATF3Q9NR55 127 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 PSENENQ9NZ42 101 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF492Q9P255 531 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 RNF24Q9Y225 148 aa4.59□□□□□ -1.67
TXNRD1-210ENST00000526207 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 GOSR2O14653 212 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 GNRH2O43555 120 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF253O75346 499 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 ANXA3P12429 323 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 SRPXP78539 464 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 MIC13Q5XKP0 118 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF546Q86UE3 836 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 SMIM4Q8WVI0 70 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 LINC01600Q96MT4 127 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 Q9UF83 564 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 NAGKQ9UJ70 344 aa4.58□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa4.57□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 SSSCA1O60232 199 aa4.57□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 NMBP08949 121 aa4.57□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 KRTAP10-8P60410 259 aa4.57□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 GUK1Q16774 197 aa4.57□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.57□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 S100A7AQ86SG5 101 aa4.57□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.57□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 GGTLC3B5MD39 225 aa4.56□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 FNDC10F2Z333 226 aa4.56□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 M0R2P5 195 aa4.56□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 LINC00694P0DN24 101 aa4.56□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 CAV2P51636 162 aa4.56□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF138P52744 262 aa4.56□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 PPP1R1AQ13522 171 aa4.56□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF266Q14584 549 aa4.56□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 RHOHQ15669 191 aa4.56□□□□□ -1.68
TXNRD1-210ENST00000526207 VWC2Q2TAL6 325 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 229.1 ms