RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520837.5

TSPAN18-208, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF492Q9P255 531 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN18-208ENST00000520837 XKRY2A2RUG3 117 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV3-20P01619 116 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TSPOP30536 169 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 LEPP41159 167 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 DEFB1P60022 68 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 BTF3L4Q96K17 158 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 IMMP2LQ96T52 175 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 IL36BQ9NZH7 164 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A0J9YX75 114 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM189A5PLL7 270 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 C5orf52A6NGY3 159 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 A8MWL6 223 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 OR11H12B2RN74 326 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 SH2D1AO60880 128 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 ORM1P02763 201 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 GPX1P07203 203 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TCL1AP56279 114 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 V9GYV3 84 aa6.88□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A1W2PPQ1 181 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 KNCNA6PVL3 124 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM210BQ96KR6 192 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.87□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 CA1P00915 261 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 CD7P09564 240 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 RAB5AP20339 215 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 ELOBQ15370 118 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 DEFB125Q8N687 156 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TSKUQ8WUA8 353 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 BORCS7Q96B45 105 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TPPP3Q9BW30 176 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 NAGKQ9UJ70 344 aa6.86□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 SPINK4O60575 86 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 HLA-DRB4P13762 266 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 GCSHP23434 173 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 CRIP1P50238 77 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 DNLZQ5SXM8 178 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 STHQ8IWL8 128 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 ODF3Q96PU9 254 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.85□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 RYR3Q15413 4870 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 H3BMM0 161 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 CXCL1P09341 107 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 GZMBP10144 247 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 CRISP2P16562 243 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 RAB4BP61018 213 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 NEU1Q99519 415 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 U3KQK5 164 aa6.84□□□□□ -1.31
TSPAN18-208ENST00000520837 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 C7orf71A4D174 169 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM231BA6NCW3 169 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 HIGD1CA8MV81 97 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 CDKN1BP46527 198 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 FXYD7P58549 80 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 Q6AWC8 147 aa6.83□□□□□ -1.32
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms