RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	TM4SF5	O14894	197 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RS1	O15537	224 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	LYZL6	O75951	148 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAGEA5	P43359	124 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	FRYL	O94915	3013 aa		6.41	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM236C	P0DP71	79 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL8A2	P25067	703 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8TAT8	98 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV1-16	P04430	117 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	METRN	Q9UJH8	293 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	C15orf65	H3BRN8	121 aa		6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPRY3	O43610	288 aa		6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	DPH3	Q96FX2	82 aa		6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM141	Q96I45	108 aa		6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		6.4	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNC	P24821	2201 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHG2	P01859	326 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-30	P01768	117 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	RHOH	Q15669	191 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR86	Q86TI4	376 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	BAALC	Q8WXS3	180 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF7	Q9UBF6	113 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	PTPRS	Q13332	1948 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01548	A6NM66	108 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	WT1-AS	Q06250	92 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD177	Q8N6Q3	437 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TOMM6	Q96B49	74 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRORY	Q9H606	182 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	GUSBP11	Q6P575	273 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	SVIL	O95425	2214 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL4A6	Q14031	1691 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRIAP1	O43715	76 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF134	P52741	427 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC2B	Q92478	149 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL11	P51671	97 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	RITA1	Q96K30	269 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		6.37	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	C11orf86	A6NJI1	115 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	CGB1	A6NKQ9	187 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	GGN	Q86UU5	652 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549		H7C423	109 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	LEPROT	O15243	131 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFB3	O43676	98 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL13	Q99616	98 aa		6.36	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	VCY	O14598	125 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF138	Q8WVD3	245 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	USP34	Q70CQ2	3546 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRRM5	B3KS81	715 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BRN7	92 aa		6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
CRNKL1-205	ENST00000496549	SOCS3	O14543	225 aa		6.35	□□□□□ -1.39

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