RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 ATP5G1P05496 136 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 PFN1P07737 140 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 MDFICQ9P1T7 246 aa13.52□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 FAM210BQ96KR6 192 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 SDF2L1Q9HCN8 221 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 C11orf21Q9P2W6 132 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 ZFP30Q9Y2G7 519 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 DNAH1Q9P2D7 4330 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 SPINK4O60575 86 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 IFNA1P01562 189 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 TYMSP04818 313 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 KCNS1Q96KK3 526 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 F5H768 121 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 GNRH2O43555 120 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 LY6G6CO95867 125 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 LTAP01374 205 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 TMEM88Q6PEY1 159 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 MUC4Q99102 2169 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 S100A9P06702 114 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 BCL2P10415 239 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 C11orf52Q96A22 123 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 C18orf15Q96N68 181 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 TRGV2A0A075B6R0 118 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 BLOC1S1P78537 153 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 SPXQ9BT56 116 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 FABP5P3A8MUU1 101 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRN-216ENST00000486480 SACSQ9NZJ4 4579 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 SH2D1AO60880 128 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 CRIP1P50238 77 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 NHLRC2Q8NBF2 726 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 VAX2Q9UIW0 290 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 HOXA5P20719 270 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 DERL1Q9BUN8 251 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 PDE6DO43924 150 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 OR5I1Q13606 314 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 BAGE2Q86Y30 109 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 LYPD6BQ8NI32 183 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 RASL10AQ92737 203 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 M0R2P5 195 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 ORM1P02763 201 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 MLST8Q9BVC4 326 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 NACAE9PAV3 2078 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 B4DEV8 164 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 C9orf85Q96MD7 179 aa13.41□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 RYR2Q92736 4967 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 KRBOX1C9JBD0 128 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 M0R036 132 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 IGHV3-53P01767 116 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 CENPWQ5EE01 88 aa13.4□□□□□ -0.26
PTPRN-216ENST00000486480 P0DMU3 169 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 FAM231AP0DMU4 169 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 FAM231CP0DMU5 169 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 ASIPP42127 132 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 LINC01559Q495D7 138 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 MED9Q9NWA0 146 aa13.39□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 A0A0J9YY99 117 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 NUDT3O95989 172 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 TEX261Q6UWH6 196 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 RAB19A4D1S5 217 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 RBFOX3A6NFN3 312 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF876PQ49A33 203 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF506Q5JVG8 444 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF479Q96JC4 524 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 RYR3Q15413 4870 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 C9JCJ5 164 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 H3BNG1 76 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 H3BVH4 76 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 IGLV2-8P01709 118 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 SFTA3P0C7M3 94 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 GNG4P50150 75 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 FHL2Q14192 279 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 DNLZQ5SXM8 178 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 PRR27Q6MZM9 219 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 IL36BQ9NZH7 164 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 VPS13DQ5THJ4 4388 aa13.36□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRN-216ENST00000486480 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms