RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 CRYGCP07315 174 aa12.6□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 LAGE3Q14657 143 aa12.6□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM30BQ3MIR4 351 aa12.6□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM78Q5T7P6 136 aa12.6□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 RAX2Q96IS3 184 aa12.6□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 A6NJY4 79 aa12.6□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf56Q8N813 242 aa12.6□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 A8MWV9 139 aa12.59□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF491Q8N8L2 437 aa12.59□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CDIP1Q9H305 208 aa12.59□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa12.59□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 FABP5P3A8MUU1 101 aa12.59□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A16P16260 332 aa12.59□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM14CQ9P0S9 112 aa12.59□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 M0R381 172 aa12.58□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 MGPP08493 103 aa12.58□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 RNF182Q8N6D2 247 aa12.58□□□□□ -0.39
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE5Q13069 117 aa12.58□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE6Q13070 117 aa12.58□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa12.58□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 U3KQK5 164 aa12.58□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa12.58□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 SNCGO76070 127 aa12.57□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE2BQ13066 116 aa12.57□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE2EQ4V326 116 aa12.57□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.57□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.57□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 PPDPFLQ8WWR9 84 aa12.57□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.57□□□□□ -0.43e-6■■□□□ 11.5
CCSAP-204ENST00000483092 H3BRN7 92 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 OVOL3O00110 214 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 HERV-K104P63124 156 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 RNF185Q96GF1 192 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 KAAG1Q9UBP8 84 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 S100A4P26447 101 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 LY6DQ14210 128 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 LINC00311Q8N616 119 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 C9JAW5 83 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV1-47P01700 117 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 PRO0461Q9UI25 63 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WX48 190 aa12.55□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 FHL3Q13643 280 aa12.55□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N8P6 123 aa12.55□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP12.55□□□□□ -0.45e-10■■■□□ 17.7
CCSAP-204ENST00000483092 PSMG4Q5JS54 123 aa12.55□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 ERG28Q9UKR5 140 aa12.55□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 H7C1H1 209 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 PLNP26678 52 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 IL17RELQ6ZVW7 336 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 I3L2K1 104 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM170BQ5T4T1 132 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 LYRM7Q5U5X0 104 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHB2Q96CS7 222 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 INS-IGF2F8WCM5 200 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 LYPD1Q8N2G4 141 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 NOTCH3Q9UM47 2321 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 F8VRH5 84 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV4-39P01824 125 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 TAL2Q16559 108 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 PRAC2D3DTV9 90 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 K7EIM0 57 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF688P0C7X2 276 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.53□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa12.52□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa12.52□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 TEX22C9J3V5 150 aa12.52□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 TSPAN13O95857 204 aa12.52□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 TEN1Q86WV5 123 aa12.52□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 CFHR4Q92496 578 aa12.52□□□□□ -0.4
CCSAP-204ENST00000483092 MFAP4P55083 255 aa12.52□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PVRIGQ6DKI7 326 aa12.52□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 DYNAPQ8N1N2 210 aa12.52□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 RAB1BQ9H0U4 201 aa12.52□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TCL1BO95988 128 aa12.52□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TIMD4Q96H15 378 aa12.52□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa12.51□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa12.51□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ADORA2A-AS1P86434 159 aa12.51□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PAX8Q06710 450 aa12.51□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CACNA1AO00555 2505 aa12.51□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZQT7 251 aa12.5□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CARD19Q96LW7 228 aa12.5□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ZMAT4Q9H898 229 aa12.5□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 C21orf62Q9NYP8 219 aa12.5□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 DPM3Q9P2X0 92 aa12.5□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GATD1Q8NB37 220 aa12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 UBTD1Q9HAC8 227 aa12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CENPEQ02224 2701 aa12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP161Q6P656 301 aa12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 OR11H6Q8NGC7 330 aa12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC179H3BU77 68 aa12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 IGLC6P0CF74 106 aa12.49□□□□□ -0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 256.8 ms