RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 OR5AL1P0C617 328 aa6.72□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 EVI2AP22794 236 aa6.72□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.72□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.71□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.71□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.71□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.71□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 Q96MF0 132 aa6.71□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM191AQ9H0A3 160 aa6.71□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 SMPXQ9UHP9 88 aa6.71□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 APCP25054 2843 aa6.71□□□□□ -1.33
CDHR3-211ENST00000478080 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 J3QLI3 93 aa6.71□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.71□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 CNFNQ9BYD5 112 aa6.71□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.7□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 H3BVH4 76 aa6.7□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 TSPOP30536 169 aa6.7□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF747Q9BV97 191 aa6.7□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.7□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 Q6YL49 198 aa6.7□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.7□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.7□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 C20orf202A1L168 122 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 FSHBP01225 129 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 LINC00477Q96M19 166 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 OVOL1O14753 267 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 CCL25O15444 150 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 PCP4P48539 62 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF702PQ9H963 129 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 TENM4Q6N022 2769 aa6.69□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 GNRH2O43555 120 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 TNFRSF6BO95407 300 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 SYNJ2BPP57105 145 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 A0A087WW49 117 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 PTTG1IPP53801 180 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 DCANP1Q8TF63 244 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 CREBBPQ92793 2442 aa6.68□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 SORL1Q92673 2214 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 M0R381 172 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 IGKV3-20P01619 116 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF688P0C7X2 276 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 DEFB136Q30KP8 78 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 PET117Q6UWS5 81 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 C18orf15Q96N68 181 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF580Q9UK33 172 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 K7EMT4 169 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 LINC01545Q5VT33 79 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 COX11Q9Y6N1 276 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 AGRNO00468 2067 aa6.67□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.66□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 UBE2V1Q13404 147 aa6.66□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 MPV17L2Q567V2 206 aa6.66□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.66□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.66□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 HBDP02042 147 aa6.66□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 PSMG4Q5JS54 123 aa6.66□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 DUX3Q96PT4 197 aa6.66□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 PPBPP02775 128 aa6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 LEPP41159 167 aa6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 CACNG7P62955 275 aa6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 ITPR3Q14573 2671 aa6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 RBX1P62877 108 aa6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 NRACQ8N912 160 aa6.65□□□□□ -1.34
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.64□□□□□ -1.35
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.64□□□□□ -1.35
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.64□□□□□ -1.35
CDHR3-211ENST00000478080 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CDHR3-211ENST00000478080 ASIPP42127 132 aa6.64□□□□□ -1.35
CDHR3-211ENST00000478080 SLURP1P55000 103 aa6.64□□□□□ -1.35
CDHR3-211ENST00000478080 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.64□□□□□ -1.35
CDHR3-211ENST00000478080 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa6.64□□□□□ -1.35
CDHR3-211ENST00000478080 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.64□□□□□ -1.35
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