RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-211ENST00000476336 CCL18P55774 89 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-211ENST00000476336 UBE2G2P60604 165 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-211ENST00000476336 MUC21Q5SSG8 566 aa9.37□□□□□ -0.91
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PRAME-211ENST00000476336 AKAP14Q86UN6 197 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-211ENST00000476336 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-211ENST00000476336 RASL10AQ92737 203 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-211ENST00000476336 FMC1Q96HJ9 113 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-211ENST00000476336 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.37□□□□□ -0.91
PRAME-211ENST00000476336 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.36□□□□□ -0.91
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PRAME-211ENST00000476336 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.36□□□□□ -0.91
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PRAME-211ENST00000476336 MDFICQ9P1T7 246 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-211ENST00000476336 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.34□□□□□ -0.91
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PRAME-211ENST00000476336 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.28□□□□□ -0.92
PRAME-211ENST00000476336 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
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PRAME-211ENST00000476336 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.28□□□□□ -0.92
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PRAME-211ENST00000476336 B4DEV8 164 aa9.27□□□□□ -0.93
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PRAME-211ENST00000476336 Q6ZR54 194 aa9.27□□□□□ -0.93
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PRAME-211ENST00000476336 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PRAME-211ENST00000476336 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-211ENST00000476336 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.27□□□□□ -0.93
PRAME-211ENST00000476336 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.26□□□□□ -0.93
PRAME-211ENST00000476336 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-211ENST00000476336 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PRAME-211ENST00000476336 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.26□□□□□ -0.93
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