RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445706.5

PACSIN2-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN2, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2-208ENST00000445706 GNRH2O43555 120 aa7.36□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 VAMP1P23763 118 aa7.36□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 ZNF138P52744 262 aa7.36□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.36□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 DPPA3Q6W0C5 159 aa7.36□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 MGST2Q99735 147 aa7.36□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 PSENENQ9NZ42 101 aa7.36□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 A0A087WYN8 130 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 LYRM1O43325 122 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 SEC11BP0C7V7 166 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 LINC00694P0DN24 101 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 RAB31Q13636 194 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 Q6AWC8 147 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 NAGKQ9UJ70 344 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.35□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 NDUFB6O95139 128 aa7.34□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 PDE6HQ13956 83 aa7.34□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 REG3GQ6UW15 175 aa7.34□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.34□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.34□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.34□□□□□ -1.23
PACSIN2-208ENST00000445706 A0A087WWC5 75 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 GAGE12JA6NER3 117 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 CHTF8P0CG12 524 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 PYYP10082 97 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 GAGE1Q13065 139 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 GAGE4Q13068 117 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 GAGE5Q13069 117 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 GAGE13Q4V321 117 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 RNF185Q96GF1 192 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 Q9UF83 564 aa7.33□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 SSSCA1O60232 199 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 CIDEAO60543 219 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 UPK1BO75841 260 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 SFT2D2O95562 160 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 HLA-DQA1P01909 254 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 TYMSP04818 313 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 HOXB5P09067 269 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 DEFA1P59665 94 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 DEFA3P59666 94 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 ID3Q02535 119 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 ARL16Q0P5N6 197 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 Q0VG73 95 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 ZNF876PQ49A33 203 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 MIC13Q5XKP0 118 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 ENKURQ8TC29 256 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 C7orf33Q8WU49 177 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 DPH3Q96FX2 82 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 SMIM8Q96KF7 97 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.32□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.31□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 PLA2G10O15496 165 aa7.31□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 BTCP35070 178 aa7.31□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 CAV2P51636 162 aa7.31□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 PPP1R1AQ13522 171 aa7.31□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 Q6ZRG5 221 aa7.31□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.31□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 A0A087WX48 190 aa7.3□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 TCRBP04435 133 aa7.3□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 CAMLGP49069 296 aa7.3□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 ELOBQ15370 118 aa7.3□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.3□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 ENHOQ6UWT2 76 aa7.3□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 PFDN5Q99471 154 aa7.3□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 NUDT15Q9NV35 164 aa7.3□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.3□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.29□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 C9orf170A2RU37 121 aa7.29□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.29□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 ATP5SQ99766 215 aa7.29□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.29□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 RBAKDNA6NC62 111 aa7.28□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.28□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 GTSF1Q8WW33 167 aa7.28□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 GGACTQ9BVM4 153 aa7.28□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.28□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.28□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.28□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 VAX2Q9UIW0 290 aa7.28□□□□□ -1.24
PACSIN2-208ENST00000445706 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.27□□□□□ -1.25
PACSIN2-208ENST00000445706 PGPA6NDG6 321 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87 ms