RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431381.5

CITED1-206, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CITED1, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-206ENST00000431381 KCNS1Q96KK3 526 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 LINC01587Q99440 93 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 CSTL1Q9H114 145 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.63□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 ASIPP42127 132 aa9.62□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 APOC4P55056 127 aa9.62□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 Q6ZQT7 251 aa9.62□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 NEU1Q99519 415 aa9.62□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.62□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.62□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 CBY3A6NI87 242 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 HIGD1CA8MV81 97 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 BTF3L4Q96K17 158 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.61□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 FAM231BA6NCW3 169 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 SPINK4O60575 86 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.6□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.59□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 GNRH2O43555 120 aa9.59□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 SSTP61278 116 aa9.59□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 ELOBQ15370 118 aa9.59□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 NUP35Q8NFH5 326 aa9.59□□□□□ -0.87
CITED1-206ENST00000431381 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 H3BVH4 76 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 TYMSP04818 313 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 CXCL1P09341 107 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 GTSF1Q8WW33 167 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 FAM210BQ96KR6 192 aa9.58□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 F2Z2F3 143 aa9.57□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 RIGQ13278 110 aa9.57□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 TDRG1Q3Y452 100 aa9.57□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.57□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 VWFP04275 2813 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 MUC21A0A140T8X8 626 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 A0A1B0GUT8 65 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 UBE2CO00762 179 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 RAB4BP61018 213 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 ZNF415Q09FC8 603 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.56□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 IGLC6P0CF74 106 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 MED14OSP0DP75 135 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 CACNG7P62955 275 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 TWIST1Q15672 202 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.55□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 COLCA2A8K830 154 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 M0R381 172 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 S100A8P05109 93 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 OR5AL1P0C617 328 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 CTRLP40313 264 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 CAMPP49913 170 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 HBBP68871 147 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 RRN3P1Q2M238 152 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 DEFB135Q30KP9 77 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 DNLZQ5SXM8 178 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 SYT8Q8NBV8 401 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 RCHY1Q96PM5 261 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 MDFICQ9P1T7 246 aa9.54□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 A8MZ25 164 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 SNAI2O43623 268 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 PRM2P04554 102 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 RAB5AP20339 215 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 COX19Q49B96 90 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.53□□□□□ -0.88
CITED1-206ENST00000431381 YPEL4Q96NS1 127 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms