RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HLA-DQA1P01909 254 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MT-ND6P03923 174 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AKR1D1P51857 326 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HBBP68871 147 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLAQ13239 276 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIR3DS1Q14943 382 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TPPP3Q9BW30 176 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGLV1-51P01701 117 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APCSP02743 223 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGLC6P0CF74 106 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RIPPLY3P57055 190 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MUC21Q5SSG8 566 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.32□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0J9YX75 114 aa7.31□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GUT8 65 aa7.31□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 F2Z2F3 143 aa7.31□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRISP2P16562 243 aa7.31□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EBLN2Q6P2I7 272 aa7.31□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.31□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.31□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.3□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUPR1O60356 82 aa7.3□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV3-20P01619 116 aa7.3□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SSTP61278 116 aa7.3□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RIGQ13278 110 aa7.3□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.3□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.3□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GATD1Q8NB37 220 aa7.3□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.3□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KNCNA6PVL3 124 aa7.29□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GPX1P07203 203 aa7.29□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SRIP30626 198 aa7.29□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CTRLP40313 264 aa7.29□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00310P59036 64 aa7.29□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DEFB131AP59861 70 aa7.29□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF124Q15973 351 aa7.29□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q6AWC8 147 aa7.29□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KLLNB2CW77 178 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IQCJQ1A5X6 159 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NAGKQ9UJ70 344 aa7.28□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 JMJD1CQ15652 2540 aa7.27□□□□□ -1.24
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GW15 77 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OR11H12B2RN74 326 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LEPP41159 167 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q0VG73 95 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AMTNQ6UX39 209 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BORCS7Q96B45 105 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ODF3Q96PU9 254 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 M0R2Z0 102 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPRY2O43597 315 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SERF1AO75920 110 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AMBPP02760 352 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FABP4P15090 132 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.27□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C7orf71A4D174 169 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A8MTW9 85 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H3BVH4 76 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GNRH2O43555 120 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 S100A8P05109 93 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HLA-DRB4P13762 266 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NTF3P20783 257 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 S100A2P29034 98 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TSPOP30536 169 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FXYD7P58549 80 aa7.26□□□□□ -1.25
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TWIST1Q15672 202 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms