RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa12.34□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 A8MWL6 223 aa12.34□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa12.34□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa12.34□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.34□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 LINC01587Q99440 93 aa12.34□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAGKQ9UJ70 344 aa12.34□□□□□ -0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7EIL1 84 aa12.33□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXCL1P09341 107 aa12.33□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC21Q5SSG8 566 aa12.33□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6ZWC4 215 aa12.33□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CMYA5Q8N3K9 4069 aa12.33□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM231BA6NCW3 169 aa12.32□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL19P84098 196 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATRAIDQ6UW56 229 aa12.32□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSKUQ8WUA8 353 aa12.32□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12.32□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRGV11A0A075B6L2 103 aa12.31□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXorf65A6NEN9 183 aa12.31□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 IMMP2LQ96T52 175 aa12.31□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL36BQ9NZH7 164 aa12.31□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNLZQ5SXM8 178 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PPQ1 181 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 CBY3A6NI87 242 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TYMSP04818 313 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 ASIPP42127 132 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB121Q5J5C9 76 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF575Q86XF7 245 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 RCHY1Q96PM5 261 aa12.3□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SORL1Q92673 2214 aa12.29□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 GNRH2O43555 120 aa12.29□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 HTN1P15515 57 aa12.29□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB135Q30KP9 77 aa12.29□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEU1Q99519 415 aa12.29□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAT8BQ9UHF3 227 aa12.29□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa12.29□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRIFINA4D1Z8 144 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGLC6P0CF74 106 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 MED14OSP0DP75 135 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 GZMBP10144 247 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 S100PP25815 95 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 S100A4P26447 101 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNIP4Q6PIL6 250 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 GTSF1Q8WW33 167 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF183Q96D59 192 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMCO4Q9NRQ5 59 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa12.28□□□□□ -0.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.27□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 HIGD1CA8MV81 97 aa12.27□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 F2Z2F3 143 aa12.27□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRN3P1Q2M238 152 aa12.27□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF493Q6ZR52 646 aa12.27□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa12.27□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRY2O43597 315 aa12.26□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5AL1P0C617 328 aa12.26□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRAPQ8TCY5 172 aa12.26□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 C16orf74Q96GX8 76 aa12.26□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 MGAM2Q2M2H8 2515 aa12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNAI2O43623 268 aa12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTRLP40313 264 aa12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCL1AP56279 114 aa12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF415Q09FC8 603 aa12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 MDFICQ9P1T7 246 aa12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 X6R8D5 127 aa12.25□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BVH4 76 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARMS2P0C7Q2 107 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 AZU1P20160 251 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUP35Q8NFH5 326 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR11H2Q8NH07 326 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 BORCS7Q96B45 105 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9orf85Q96MD7 179 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPPP3Q9BW30 176 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCRT2Q9NQ03 307 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNHD1Q96M86 4753 aa12.24□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 AGRNO00468 2067 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAH3Q8TD57 4116 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRM2P04554 102 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 MIFP14174 115 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR73Q6P4I2 378 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM88Q6PEY1 159 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 CBLN2Q8IUK8 224 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 SBSPONQ8IVN8 264 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 C11orf72Q8NBR9 251 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTF3L4Q96K17 158 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 PGLYRP4Q96LB8 373 aa12.23□□□□□ -0.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPXQ9BT56 116 aa12.23□□□□□ -0.45
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