RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 LINC01548A6NM66 108 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 RAX2Q96IS3 184 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 MRAP2Q96G30 205 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 ODF1Q14990 250 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 RAB1BQ9H0U4 201 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 F8W1H4 67 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 RPL11P62913 178 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 POU2AF1Q16633 256 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 TRGV9Q99603 122 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 IGHV1-8P0DP01 117 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF815PA8K554 130 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 TRGV3P03979 118 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 IGKV1-17P01599 117 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 S100A4P26447 101 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa10.1□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 FSTL3O95633 263 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 THAP8Q8NA92 274 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 Q6ZQT7 251 aa10.09□□□□□ -0.79
PTPRN-202ENST00000409251 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 TIMD4Q96H15 378 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 SCGB3A1Q96QR1 104 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 CLEC3BP05452 202 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 XGP55808 180 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 RRN3P1Q2M238 152 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 DTX2Q86UW9 622 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 IGLV2-23P01705 113 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 SLC25A16P16260 332 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM155Q4W5P6 130 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 IL17RELQ6ZVW7 336 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 SMIM20Q8N5G0 67 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 FOXI1Q12951 378 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 CR1LQ2VPA4 569 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 PRR25Q96S07 402 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 E9PLD3 99 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 TIMM23O14925 209 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 IGHV4-39P01824 125 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 DEFB1P60022 68 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 ECSCRQ19T08 205 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 Q6AWC8 147 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 TEX29Q8N6K0 151 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 PRORYQ9H606 182 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 PRAC2D3DTV9 90 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 F5H697 171 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 SIVA1O15304 175 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF491Q8N8L2 437 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 NPC2P61916 151 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 NFE4Q86UQ8 179 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00527Q9UJ94 153 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 A0A1B0GW15 77 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 NDPQ00604 133 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 FABP5P3A8MUU1 101 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 C9JAW5 83 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 PRSS2P07478 247 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 LAGE3Q14657 143 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 TTC32Q5I0X7 151 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 DYNAPQ8N1N2 210 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 ATP5LO75964 103 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 Q6ZUT4 128 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 CFHR4Q92496 578 aa10.02□□□□□ -0.8
PTPRN-202ENST00000409251 BRD3OSQ6XYD6 125 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 HIVEP2P31629 2446 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 ZFAND6Q6FIF0 208 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 TEX15Q9BXT5 2789 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 DLX6P56179 175 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 FAM74A4Q5TZK3 123 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 A8MWV9 139 aa10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms