RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407417.7

NFIA-208, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 2 BASIC

Gene NFIA, Length 2,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-208	ENST00000407417	IGHV1-46	P01743	117 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	GP9	P14770	177 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	CFHR2	P36980	270 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	LOXL3	P58215	753 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	GLMP	Q8WWB7	406 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417		Q9H3A6	140 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	INAFM1	C9JVW0	142 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	CCDC179	H3BU77	68 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35	3e-6	■□□□□ 8
NFIA-208	ENST00000407417	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	CR1	P17927	2039 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	WNT9B	O14905	357 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	PRSS1	P07477	247 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	AJUBA	Q96IF1	538 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	TRGV9	Q99603	122 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	CKS2	P33552	79 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	MYOD1	P15172	320 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	MZT1	Q08AG7	82 aa		6.61	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	PRTN3	P24158	256 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	RFESD	Q8TAC1	157 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	CCL17	Q92583	94 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	RASL10A	Q92737	203 aa		6.6	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417		A0A1B0GX51	115 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	LEP	P41159	167 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	PSMB2	P49721	201 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	AMN1	Q8IY45	258 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	CNFN	Q9BYD5	112 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	ZFHX3	Q15911	3703 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	CGB3	P0DN86	165 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	CGB7	P0DN87	165 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF134	P52741	427 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	PRR31	Q5SQ13	230 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	PRNT	Q86SH4	94 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	NPIPB3	Q92617	1050 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		6.59	□□□□□ -1.35
NFIA-208	ENST00000407417	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	ID1	P41134	155 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	HES1	Q14469	280 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	PLGLA	Q15195	96 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417		Q8N8P6	123 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	SGK494	Q96LW2	274 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	IMUP	Q9GZP8	106 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	AGRN	O00468	2067 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	LINC01549	A6NIU2	74 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	TGFA	P01135	160 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	GRP	P07492	148 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	CD7	P09564	240 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	LMO4	P61968	165 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	MLANA	Q16655	118 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		6.58	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417		F8VRH5	84 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417		H7C1H1	209 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	CRLF1	O75462	422 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	PRDX2	P32119	198 aa		6.57	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
NFIA-208	ENST00000407417	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		6.57	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms