RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 COL4A5P29400 1685 aa1.22□□□□□ -2.21
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 DISP1Q96F81 1524 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC18Q5T9S5 1454 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa1.21□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa1.21□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 BLCAPP62952 87 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5AS1Q8N127 324 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C4orf33Q8N1A6 199 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4X2Q8NGF9 303 aa1.21□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 SPACA4Q8TDM5 124 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 NABP2Q9BQ15 211 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMM21Q9BVV7 248 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC11CQ9BY50 192 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C14orf132Q9NPU4 83 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RPRMQ9NS64 109 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP192Q8TEP8 1941 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 MYH4Q9Y623 1939 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 NWD2Q9ULI1 1742 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP3K1Q13233 1512 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 DOCK2Q92608 1830 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 PXDNLA1KZ92 1463 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 hDV103S1A0JD37 113 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 OOSP1A8MZH6 123 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C5orf67F2Z3F1 127 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C17orf112F2Z3M2 114 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFP01375 233 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TRACP01848 142 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CRPP02741 224 aa1.2□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 BRS3P32247 399 aa1.2□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF846Q147U1 533 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C9orf153Q5TBE3 101 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C1orf134Q5TEV5 83 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXI2Q6ZQN5 318 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 ATOH7Q8N100 152 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM19A2Q8N3H0 131 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNRGQ8N5I3 272 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00301Q8NCQ3 95 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 PLPP5Q8NEB5 264 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMF1Q92530 271 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RERGLQ9H628 205 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TPRKBQ9Y3C4 175 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 SERP1Q9Y6X1 66 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 LY96Q9Y6Y9 160 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 MPDZO75970 2070 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 FBN3Q75N90 2809 aa1.2□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 PTPRMP28827 1452 aa1.19□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 E7EUB6 86 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 M0R233 179 aa1.19□□□□□ -2.22
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RABGGTB-202ENST00000370826 PROSCO94903 275 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 UBL3O95164 117 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL26P61254 145 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 LSM3P62310 102 aaKnown RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6AWC8 147 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 Q6ZS92 163 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 UBR1Q8IWV7 1749 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 C10orf111Q8N326 155 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC9CQ8N5M4 171 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 HYLS1Q96M11 299 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-202ENST00000370826 DSCR8Q96T75 97 aa1.19□□□□□ -2.22
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