RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 SPXQ9BT56 116 aa7□□□□□ -1.29
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC32Q9BV29 185 aa7□□□□□ -1.29
CLRN3-201ENST00000368671 CDIP1Q9H305 208 aa7□□□□□ -1.29
CLRN3-201ENST00000368671 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7□□□□□ -1.29
CLRN3-201ENST00000368671 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.99□□□□□ -1.29
CLRN3-201ENST00000368671 C9JCJ5 164 aa6.99□□□□□ -1.29
CLRN3-201ENST00000368671 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLRN3-201ENST00000368671 HAMPP81172 84 aa6.99□□□□□ -1.29
CLRN3-201ENST00000368671 Q6AWC8 147 aa6.99□□□□□ -1.29
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CLRN3-201ENST00000368671 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.99□□□□□ -1.29
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CLRN3-201ENST00000368671 TAS2R45P59539 299 aa6.97□□□□□ -1.29
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CLRN3-201ENST00000368671 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.96□□□□□ -1.3
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CLRN3-201ENST00000368671 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.96□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.96□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.95□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.95□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 TDRG1Q3Y452 100 aa6.95□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.95□□□□□ -1.3
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CLRN3-201ENST00000368671 Q9HAA7 133 aa6.95□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.95□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 OTORQ9NRC9 128 aa6.95□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.95□□□□□ -1.3
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CLRN3-201ENST00000368671 HSPB11Q9Y547 144 aa6.95□□□□□ -1.3
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CLRN3-201ENST00000368671 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.94□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.94□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 TVP23CQ96ET8 276 aa6.94□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 SGK494Q96LW2 274 aa6.94□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 TREM1Q9NP99 234 aa6.94□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.93□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.93□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1W2PPV4 95 aa6.93□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.93□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.93□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 IGHV3-30P01768 117 aa6.93□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 IGHV3-33P01772 117 aa6.93□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.93□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.93□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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CLRN3-201ENST00000368671 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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CLRN3-201ENST00000368671 MPC2O95563 127 aa6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 PET100P0DJ07 73 aa6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 TIRAPP58753 221 aa6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 RAB2AP61019 212 aa6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 Q6ZSN1 163 aa6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 Q8N814 137 aa6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.92□□□□□ -1.3
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.92□□□□□ -1.3
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