RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340369.3

XIRP1-201, Transcript of xin actin binding repeat containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene XIRP1, Length 6,460 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1-201ENST00000340369 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
XIRP1-201ENST00000340369 NOTCH2Q04721 2471 aa9.96□□□□□ -0.81
XIRP1-201ENST00000340369 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.96□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.96□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.96□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.96□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 ZNF134P52741 427 aa9.96□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 MYLKQ15746 1914 aa9.96□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.96□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.95□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 WIPF3A6NGB9 483 aa9.95□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 K7ERJ3 54 aa9.95□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 ZNF726P1Q15940 193 aa9.95□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa9.94□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 RS1O15537 224 aa9.94□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 Q6ZWC4 215 aa9.94□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.94□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa9.93□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 VOPP1Q96AW1 172 aa9.92□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 IGLC3P0DOY3 106 aa9.92□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.92□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.92□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 F8VRH5 84 aa9.91□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 A0A1W2PPM0 123 aa9.91□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 H3BMG7 143 aa9.91□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 GNRH2O43555 120 aa9.91□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 DKK2Q9UBU2 259 aa9.91□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 ABCA1O95477 2261 aa9.91□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 K7EP13 123 aa9.9□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 SPRNQ5BIV9 151 aa9.9□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 FXYD5Q96DB9 178 aa9.9□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 ESM1Q9NQ30 184 aa9.9□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.9□□□□□ -0.82
XIRP1-201ENST00000340369 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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XIRP1-201ENST00000340369 U3KQE9 123 aa9.9□□□□□ -0.83
XIRP1-201ENST00000340369 DEFB4AO15263 64 aa9.89□□□□□ -0.83
XIRP1-201ENST00000340369 MYCNOSP40205 109 aa9.89□□□□□ -0.83
XIRP1-201ENST00000340369 RHOHQ15669 191 aa9.89□□□□□ -0.83
XIRP1-201ENST00000340369 C17orf77Q96MU5 243 aa9.89□□□□□ -0.83
XIRP1-201ENST00000340369 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.89□□□□□ -0.83
XIRP1-201ENST00000340369 HIVEP2P31629 2446 aa9.89□□□□□ -0.83
XIRP1-201ENST00000340369 GTF3C1Q12789 2109 aa9.89□□□□□ -0.83
XIRP1-201ENST00000340369 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.89□□□□□ -0.83
XIRP1-201ENST00000340369 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.89□□□□□ -0.83
XIRP1-201ENST00000340369 LINC00311Q8N616 119 aa9.89□□□□□ -0.83
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