RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 SPINK8P0C7L1 97 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 ADORA2A-AS1P86434 159 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 A6NDX4 124 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 C11orf86A6NJI1 115 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 CTSGP08311 255 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 P0C879 139 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 CRYBA4P53673 196 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 PRORYQ9H606 182 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-201ENST00000261266 LY6HO94772 140 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRB-201ENST00000261266 U3KQE9 123 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRB-201ENST00000261266 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.02□□□□□ -1.29
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PTPRB-201ENST00000261266 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.02□□□□□ -1.29
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PTPRB-201ENST00000261266 PATE2Q6UY27 113 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRB-201ENST00000261266 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7□□□□□ -1.29
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PTPRB-201ENST00000261266 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-201ENST00000261266 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-201ENST00000261266 C14orf177Q52M58 125 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRB-201ENST00000261266 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-201ENST00000261266 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-201ENST00000261266 GNRH2O43555 120 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-201ENST00000261266 CCL18P55774 89 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-201ENST00000261266 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-201ENST00000261266 TRACP01848 142 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-201ENST00000261266 SEC16AO15027 2179 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-201ENST00000261266 H3BMG7 143 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-201ENST00000261266 PFN2P35080 140 aa6.96□□□□□ -1.3
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