RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636022.1

CACNA1A-222, Transcript of calcium voltage-gated channel subunit alpha1 A, human

TSL 3

Gene CACNA1A, Length 552 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNA1A-222	ENST00000636022	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	ATG101	Q9BSB4	218 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022		M0R3E3	92 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	DLEU1	O43261	78 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	HOXA5	P20719	270 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	S100A10	P60903	97 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	HBG1	P69891	147 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	HBG2	P69892	147 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	BAX	Q07812	192 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	ATP6V1F	Q16864	119 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	ZNF575	Q86XF7	245 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	ZNF503	Q96F45	646 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	HERC1	Q15751	4861 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CACNA1A-222	ENST00000636022	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	GAGE12B	A1L429	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	KLLN	B2CW77	178 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022		G3V3Q6	166 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022		J3KRW8	73 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	MPDU1	O75352	247 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	GAGE7	O76087	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	GAGE12F	P0CL80	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	GAGE12G	P0CL81	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	GAGE12I	P0CL82	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	PYY	P10082	97 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	FGF7	P21781	194 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	LEP	P41159	167 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	CCL18	P55774	89 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	ERCC8	Q13216	396 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	PDE6H	Q13956	83 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	WDR73	Q6P4I2	378 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	SSX7	Q7RTT5	188 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	FAT1	Q14517	4588 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022		A0A0J9YY99	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022		A0A1W2PPQ1	181 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	COLCA2	A8K830	154 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	SNURFL	B1AK76	121 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022		H0YIZ8	118 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022		H3BNG1	76 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	SIX6	O95475	246 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	GHRH	P01286	108 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	CRISP2	P16562	243 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	RAB5B	P61020	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	PKIA	P61925	76 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	OR5I1	Q13606	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	ESRG	Q1W209	222 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022		Q6ZTI0	123 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	THAP6	Q8TBB0	222 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	LINC00477	Q96M19	166 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	C18orf15	Q96N68	181 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	C7orf71	A4D174	169 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	APOC3	P02656	99 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	DDT	P30046	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	CLINT1	Q14677	625 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	UQCC3	Q6UW78	93 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022		Q6ZQT7	251 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	BLNK	Q8WV28	456 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	VGLL1	Q99990	258 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022	NMES1	Q9C002	83 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CACNA1A-222	ENST00000636022		Q9H8V8	135 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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