RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 E5RGE8 158 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF415Q09FC8 603 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLAQ13239 276 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ASAH1Q13510 395 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF266Q14584 549 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MUC21Q5SSG8 566 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MDFICQ9P1T7 246 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RBAKDNA6NC62 111 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SFTA3P0C7M3 94 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RANP62826 216 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ZNF479Q96JC4 524 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NMES1Q9C002 83 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 K7EQD1 137 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR7C2O60412 319 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ERVFC1-1P60608 527 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 Q6AWC8 147 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 A0A087WTM6 91 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DIRC3C9JPN6 131 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EREGO14944 169 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CSN1S1P47710 185 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 XGP55808 180 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 H2BFSP57053 126 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NFE4Q86UQ8 179 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RASL10AQ92737 203 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SPXQ9BT56 116 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EPM2AB3EWF7 344 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GYPEP15421 78 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SRIP30626 198 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ENKURQ8TC29 256 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ATP5SQ99766 215 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ORM1P02763 201 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KRTAP10-1P60331 282 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IFITM3Q01628 133 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TDRG1Q3Y452 100 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 KHDC3LQ587J8 217 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TMED6Q8WW62 240 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 S100ZQ8WXG8 99 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HSPB11Q9Y547 144 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 K7EP13 123 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 GNRH2O43555 120 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 UPK1BO75841 260 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TVP23CQ96ET8 276 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 HYLS1Q96M11 299 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OTORQ9NRC9 128 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NAGKQ9UJ70 344 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 PGPA6NDG6 321 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 C9JCJ5 164 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 M0R2P5 195 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MPC2O95563 127 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 EVI2AP22794 236 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TAS2R45P59539 299 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 MBD2Q9UBB5 411 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.46□□□□□ -1.22
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 F6UZH7 168 aa7.46□□□□□ -1.22
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IFNA5P01569 189 aa7.46□□□□□ -1.22
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 TYMSP04818 313 aa7.46□□□□□ -1.22
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CRYGDP07320 174 aa7.46□□□□□ -1.22
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.46□□□□□ -1.22
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms