RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568936.1

CCNDBP1-214, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-214ENST00000568936 PSG3Q16557 428 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 TCF24Q7RTU0 167 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A1B0GXF2 115 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 SERF1AO75920 110 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 ERCC8Q13216 396 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 PSG8Q9UQ74 426 aa8.76□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 CSN1S1P47710 185 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 CTAG1AP78358 180 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 FHL3Q13643 280 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 IQCJQ1A5X6 159 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 DPF1Q92782 380 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 C16orf92Q96LL3 132 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 C8orf49Q96NF6 230 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 NRN1Q9NPD7 142 aa8.75□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 SRIP30626 198 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 PKIAP61925 76 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 HBBP68871 147 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 SLAQ13239 276 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q8TAT8 98 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 DCANP1Q8TF63 244 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 WNK1Q9H4A3 2382 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 TSTD3H0UI37 97 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 GTSF1Q8WW33 167 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.74□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 F2Z2F3 143 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 CCL24O00175 119 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 CSN3P07498 182 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 CRIP1P50238 77 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 KCNS1Q96KK3 526 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 F6UB75 175 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 TFPI2P48307 235 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 CAMPP49913 170 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 PRR25Q96S07 402 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 CT45A10P0DMU9 189 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.71□□□□□ -1.01
CCNDBP1-214ENST00000568936 SCGB1D1O95968 90 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 GPX1P07203 203 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q6ZWC4 215 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF738Q8NE65 137 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 NAGKQ9UJ70 344 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 K7EQG2 157 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 RCHY1Q96PM5 261 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 SORL1Q92673 2214 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 JMJD1CQ15652 2540 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 RBAKDNA6NC62 111 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 AMTP48728 403 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q6AWC8 147 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 PEMTQ9UBM1 199 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF688P0C7X2 276 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 DDTP30046 118 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 Q6ZQT7 251 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF664Q8N3J9 261 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 PRO1933Q9H354 126 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 AGRNO00468 2067 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A1B0GUT8 65 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 A0A1B0GW15 77 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 BMI1P35226 326 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 RIGQ13278 110 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF575Q86XF7 245 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 OVOL1O14753 267 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 DEFA6Q01524 100 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 PRR9Q5T870 116 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 VWFP04275 2813 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 M0QZ24 198 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 PMCHP20382 165 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF138P52744 262 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms