RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 FMC1Q96HJ9 113 aa3.51□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 PAXXQ9BUH6 204 aa3.51□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 Q9UF83 564 aa3.51□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa3.51□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 MTORP42345 2549 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 MGAQ8IWI9 3026 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 A0A0B4J2C4 111 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 EPM2AB3EWF7 344 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 CCL16O15467 120 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 LTAP01374 205 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 IGHG2P01859 326 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 ELANEP08246 267 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 COX6CP09669 75 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 MYCNOSP40205 109 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 UBE2D1P51668 147 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 APOC4P55056 127 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 TFF3Q07654 80 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 LY6KQ17RY6 165 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM52Q8NDY8 209 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 RFESDQ8TAC1 157 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 NABP2Q9BQ15 211 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 SRXN1Q9BYN0 137 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.5□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 C19orf71A6NCJ1 209 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 C16orf97H3BN30 126 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 PAX4O43316 350 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 GRPP07492 148 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 GLI4P10075 376 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 CA6P23280 308 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM52BQ4KMG9 183 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 ARTNQ5T4W7 220 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 C5orf38Q86SI9 138 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 LINC00482Q8N8I6 264 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 DEFB124Q8NES8 71 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 C1orf159Q96HA4 380 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 METTL26Q96S19 204 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF492Q9P255 531 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 PDZD2O15018 2839 aa3.49□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 ATG2BQ96BY7 2078 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 A0A087WWL8 130 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 LYRM9A8MSI8 78 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 UPK2O00526 184 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 CCL21O00585 134 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 NDUFC1O43677 76 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 NDUFS5O43920 106 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 TIMM17BO60830 172 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 IGLV1-40P01703 118 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 PRSS1P07477 247 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 SLC25A16P16260 332 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 EDDM3BP56851 147 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 DAD1P61803 113 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 C9orf57Q5W0N0 161 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.48□□□□□ -1.85
C15orf40-210ENST00000563387 LY6G5BQ8NDX9 201 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms