RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 UBE2CO00762 179 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 FABP4P15090 132 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 DCANP1Q8TF63 244 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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CS-215ENST00000549143 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 APCSP02743 223 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 CRISP2P16562 243 aa6.35□□□□□ -1.39
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CS-215ENST00000549143 BMI1P35226 326 aa6.35□□□□□ -1.39
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CS-215ENST00000549143 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 RNF114Q9Y508 228 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 IFITM10A6NMD0 228 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 SRIP30626 198 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 ID1P41134 155 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
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CS-215ENST00000549143 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 WDR73Q6P4I2 378 aa6.34□□□□□ -1.39
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CS-215ENST00000549143 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 RAX2Q96IS3 184 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-215ENST00000549143 RBAKDNA6NC62 111 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 F2Z2F3 143 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 HLA-DQA1P01909 254 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 GPX1P07203 203 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 CT83Q5H943 113 aa6.34□□□□□ -1.4
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CS-215ENST00000549143 BAGE3Q86Y29 109 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.34□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GUT8 65 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 A8MWP6 167 aa6.33□□□□□ -1.4
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CS-215ENST00000549143 LGALS9O00182 355 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 SPRY2O43597 315 aa6.33□□□□□ -1.4
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CS-215ENST00000549143 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 NUPR1O60356 82 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 REC114Q7Z4M0 266 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.33□□□□□ -1.4
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CS-215ENST00000549143 OVOL1O14753 267 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 MT-ND6P03923 174 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 PAFAH1B2P68402 229 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 ZNF124Q15973 351 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.32□□□□□ -1.4
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CS-215ENST00000549143 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 TWIST1Q15672 202 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 IQCJQ1A5X6 159 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 BORCS7Q96B45 105 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 LINC00477Q96M19 166 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 TMEM160Q9NX00 188 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 M0R2Z0 102 aa6.31□□□□□ -1.4
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CS-215ENST00000549143 JMJD8Q96S16 334 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GXF2 115 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 FAM231BA6NCW3 169 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 TCF21O43680 179 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 SERF1AO75920 110 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 NTF3P20783 257 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 DEFB131AP59861 70 aa6.31□□□□□ -1.4
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CS-215ENST00000549143 C12orf57Q99622 126 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 KNCNA6PVL3 124 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 K7EQG2 157 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 HTN1P15515 57 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 FXYD7P58549 80 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 RIGQ13278 110 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 RCHY1Q96PM5 261 aa6.31□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 CSN3P07498 182 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-215ENST00000549143 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.3□□□□□ -1.4
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