RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 M0R3E3 92 aa10.93□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 CXorf1O96002 111 aa10.93□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 GCHFRP30047 84 aa10.93□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 TNP2Q05952 138 aa10.93□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 SLC51BQ86UW2 128 aa10.93□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.93□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 OR10J6PQ8NGY7 276 aa10.93□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.93□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 AAMDCQ9H7C9 122 aa10.93□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 ABCA13Q86UQ4 5058 aa10.92□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.92□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 J3KRW8 73 aa10.92□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 ICAM4Q14773 271 aa10.92□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa10.92□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 Q9H3A6 140 aa10.92□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 CCL18P55774 89 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 OR5I1Q13606 314 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 DPPA3Q6W0C5 159 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 CCDC28AQ8IWP9 274 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 C6orf223Q8N319 242 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 LINC00612Q8N6U2 182 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 TMED6Q8WW62 240 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 ODF3Q96PU9 254 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 OTORQ9NRC9 128 aa10.91□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 HSPG2P98160 4391 aa10.9□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 CT45A10P0DMU9 189 aa10.9□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 FHITP49789 147 aa10.9□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 RANP62826 216 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 MBD3L1Q8WWY6 194 aa10.9□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM167BQ9NRX6 74 aa10.9□□□□□ -0.66
KCNQ1-206ENST00000526095 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.89□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 RBAKDNA6NC62 111 aa10.89□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.89□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 HOXA5P20719 270 aa10.89□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.89□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM19A4Q96LR4 140 aa10.89□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa10.89□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.89□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 GAGE12BA1L429 117 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 GAGE7O76087 117 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 GAGE12FP0CL80 117 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 GAGE12GP0CL81 117 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 GAGE12IP0CL82 117 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 LEPP41159 167 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 RAB5CP51148 216 aa10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A0J9YY99 117 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A1W2PRE2 83 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 SNURFLB1AK76 121 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 GGTLC3B5MD39 225 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 DIRC3C9JPN6 131 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 SULT1A2P50226 295 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 RXFP4Q8TDU9 374 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 LINC00477Q96M19 166 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 LRP1BQ9NZR2 4599 aa10.87□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 PGPA6NDG6 321 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 C16orf90A8MZG2 172 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 CSN1S1P47710 185 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 ERCC8Q13216 396 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM74A1Q5RGS3 127 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 VGLL1Q99990 258 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.86□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.85□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 CRISP2P16562 243 aa10.85□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 Q6ZTI0 123 aa10.85□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 C5orf17Q8NAS9 161 aa10.85□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.85□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 Q9H8V8 135 aa10.85□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM74A7A6NL05 159 aa10.84□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 KLLNB2CW77 178 aa10.84□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 NMBP08949 121 aa10.84□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 ESRGQ1W209 222 aa10.84□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF492Q9P255 531 aa10.84□□□□□ -0.67
KCNQ1-206ENST00000526095 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 C7orf71A4D174 169 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 H2AFB1P0C5Y9 115 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 BTN1A1Q13410 526 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 C11orf72Q8NBR9 251 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 CMTM2Q8TAZ6 248 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 SFT2D1Q8WV19 159 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 UPK3BQ9BT76 320 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.83□□□□□ -0.68
KCNQ1-206ENST00000526095 LENEPQ9Y5L5 61 aa10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms