RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514515.5

NREP-222, Transcript of neuronal regeneration related protein, human

TSL 1 (best)

Gene NREP, Length 3,564 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NREP-222	ENST00000514515	CEACAM3	P40198	252 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	LAGE3	Q14657	143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		F8W1H4	67 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SPRY2	O43597	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TRGV3	P03979	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		M0R381	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CD3E	P07766	207 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		Q6ZS92	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		Q8N8P6	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	APOM	O95445	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TGFA	P01135	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CFHR4	Q92496	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ZZEF1	O43149	2961 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	NDUFS8	O00217	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CLEC3B	P05452	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	PSMB2	P49721	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	CKS1B	P61024	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	RNF5	Q99942	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		E9PLD3	99 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		H3BVH4	76 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	MGP	P08493	103 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	INSL3	P51460	131 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	RAX	Q9Y2V3	346 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515		B9A039	149 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	RAB9A	P51151	201 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	PAX8	Q06710	450 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NREP-222	ENST00000514515	AGRN	O00468	2067 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	CTSG	P08311	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	NDP	Q00604	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515		A0A087WX48	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	PLN	P26678	52 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	EMP1	P54849	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515		H7C1H1	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	C20orf78	Q9BR46	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515		Q6ZQT7	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	LINC01559	Q495D7	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515		A6NJY4	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515		F8VRH5	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NREP-222	ENST00000514515	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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