RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 TNFRSF6BO95407 300 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 CNTFRP26992 372 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 HERV-K104P63124 156 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 KIR2DL5AQ8N109 375 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 C2orf70A6NJV1 201 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 PMVKQ15126 192 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 DNAH14Q0VDD8 3507 aa4.52□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 IFITM1P13164 125 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 BATFQ16520 125 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 CNFNQ9BYD5 112 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 H3BVH4 76 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 CXCL5P42830 114 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TFPI2P48307 235 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 SYNJ2BPP57105 145 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 HERVK_113P63121 156 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 Q1RN00 199 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 SPTA1P02549 2419 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 HILS1P60008 231 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 CFAP161Q6P656 301 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.51□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 A0A1B0GXF2 115 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 LYRM9A8MSI8 78 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 D6R8Y8 96 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 K7EQG2 157 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TDRG1Q3Y452 100 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 HIGD1BQ9P298 99 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 MED13Q9UHV7 2174 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 GZMBP10144 247 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 PSMB8P28062 276 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 DEFB131AP59861 70 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 SS18Q15532 418 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 A0A0J9YX75 114 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 F8WDY8 70 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 IGHV3-23P01764 117 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 IGHV4-59P01825 116 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 ZNF688P0C7X2 276 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 SPRNQ5BIV9 151 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 HIST1H4GQ99525 98 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 DMDP11532 3685 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 SVILO95425 2214 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 CACNA1DQ01668 2161 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 F8VRH5 84 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 G3V318 75 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 ERCC8Q13216 396 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 PCNX3Q9H6A9 2034 aa4.5□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 FCN3O75636 299 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 IGLC6P0CF74 106 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 CD28P10747 220 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 C3orf56Q8N813 242 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 PIFOQ8TCI5 191 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 ORAOV1Q8WV07 137 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 A0A0J9YXY3 114 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 C9JQL5 133 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 PLA2G2AP14555 144 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 CFHR3Q02985 330 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 DEFB125Q8N687 156 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 H0Y8G0 127 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 IGHV3-48P01763 117 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TMEM243Q9BU79 118 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 U3KQK5 164 aa4.49□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TMEM262E9PQX1 116 aa4.48□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.48□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.48□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TANC2Q9HCD6 1990 aa4.48□□□□□ -1.69
POLK-215ENST00000514141 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.48□□□□□ -1.69
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