RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 H0YIZ8 118 aa11.57□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 CRYBA4P53673 196 aa11.57□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 RANP62826 216 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 FHL2Q14192 279 aa11.57□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 MUC21Q5SSG8 566 aa11.57□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 NMES1Q9C002 83 aa11.57□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 KCNIP2Q9NS61 270 aa11.57□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 OR7C2O60412 319 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 PRAF2O60831 178 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 ZNF415Q09FC8 603 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 SLAQ13239 276 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 ENKURQ8TC29 256 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.56□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 CSN1S1P47710 185 aa11.55□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 ZNF266Q14584 549 aa11.55□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 MDFICQ9P1T7 246 aa11.55□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.54□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 S100ZQ8WXG8 99 aa11.54□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 RBAKDNA6NC62 111 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 SFTA3P0C7M3 94 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.53□□□□□ -0.56
HERC3-211ENST00000513325 FFAR4Q5NUL3 377 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 ZNF479Q96JC4 524 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 ATP5SQ99766 215 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.52□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 DIRC3C9JPN6 131 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 K7EQD1 137 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 EREGO14944 169 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 SRIP30626 198 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 H2BFSP57053 126 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 ERVFC1-1P60608 527 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 TMEM183BQ1AE95 376 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 Q6AWC8 147 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 RASL10AQ92737 203 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 SPXQ9BT56 116 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 UPK1BO75841 260 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 KHDC3LQ587J8 217 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 IQCF2Q8IXL9 164 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 HYLS1Q96M11 299 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 SMIM3Q9BZL3 60 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 HSPB11Q9Y547 144 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.5□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 GYPEP15421 78 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 IFITM3Q01628 133 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 NFE4Q86UQ8 179 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 NAGKQ9UJ70 344 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 MPC2O95563 127 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 IFNA5P01569 189 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R45P59539 299 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 PTTG2Q9NZH5 202 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.48□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 A0A087WTM6 91 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 PGPA6NDG6 321 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 GNRH2O43555 120 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 ORM1P02763 201 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 TDRG1Q3Y452 100 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 TMED6Q8WW62 240 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 OTORQ9NRC9 128 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 MBD2Q9UBB5 411 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.46□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 EPM2AB3EWF7 344 aa11.46□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 EVI2AP22794 236 aa11.46□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 RPL12P30050 165 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.46□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.46□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.46□□□□□ -0.57
HERC3-211ENST00000513325 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 C9JCJ5 164 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 K7EP13 123 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 M0R2P5 195 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 SSNA1O43805 119 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 XGP55808 180 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 FAM74A1Q5RGS3 127 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-211ENST00000513325 WFDC1Q9HC57 220 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms