RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, human

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP46-208	ENST00000512656	SLA	Q13239	276 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ESRG	Q1W209	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656		Q6ZTI0	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	KLLN	B2CW77	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656		M0R3E3	92 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ERCC8	Q13216	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656		A0A096LPF7	62 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	SIVA1	O15304	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	PLA2G10	O15496	165 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	SPINK4	O60575	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	NDUFB4	O95168	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	CRISP2	P16562	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	TCL1A	P56279	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	BTN1A1	Q13410	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	RAB32	Q13637	225 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	IGSF23	A1L1A6	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	NXPH4	O95158	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	PYY	P10082	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	CSN1S1	P47710	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ZNF138	P52744	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	LINC00315	P59091	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	CD300C	Q08708	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	IL15RA	Q13261	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	VGLL1	Q99990	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.93	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656		E5RGE8	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656		K7EP13	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	OR7C2	O60412	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	ORM1	P02763	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	OR10J4	P0C629	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	CRYBA4	P53673	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
USP46-208	ENST00000512656	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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