RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511313.5

POLR2J3-215, Transcript of RNA polymerase II subunit J3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR2J3, Length 4,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3-215ENST00000511313 CCL25O15444 150 aa7.34□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 ATP5LO75964 103 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 NCR2O95944 276 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 HBBP68871 147 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 CENPWQ5EE01 88 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 CT83Q5H943 113 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.34□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 MRAP2Q96G30 205 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 CCDC140Q96MF4 163 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM243Q9BU79 118 aa7.34□□□□□ -1.23
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POLR2J3-215ENST00000511313 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.34□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.33□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00862A6NCI5 91 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 IGKV1-39P01597 117 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 IGKV1D-39P04432 117 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 HLA-DMBP28068 263 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.32□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 SSTP61278 116 aa7.32□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 CD300CQ08708 224 aa7.32□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 PRR20DP86480 221 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 PRR20BP86481 221 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 PRR20AP86496 221 aa7.31□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.31□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 CYSLTR1Q9Y271 337 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 HCFC1P51610 2035 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 PCSK5Q92824 1860 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 ORMDL3Q8N138 153 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 NXPH4O95158 308 aa7.3□□□□□ -1.24
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POLR2J3-215ENST00000511313 U3KQE9 123 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 K7EMI3 77 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 LRRK2Q5S007 2527 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 PRSS1P07477 247 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 H3BVH4 76 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 A0A0G2JRQ6 117 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 LY6G6CO95867 125 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 OR5AL1P0C617 328 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 SH2D1AO60880 128 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 TNFRSF6BO95407 300 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 BTCP35070 178 aa7.28□□□□□ -1.24
POLR2J3-215ENST00000511313 IMMP2LQ96T52 175 aa7.28□□□□□ -1.24
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